Protein–RNA interactions for Protein: P45378

TNNT3, Troponin T, fast skeletal muscle, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT3P45378 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNNT3P45378 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNNT3P45378 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNNT3P45378 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNNT3P45378 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNNT3P45378 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNNT3P45378 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNNT3P45378 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNNT3P45378 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNNT3P45378 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNNT3P45378 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNNT3P45378 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNNT3P45378 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNNT3P45378 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNNT3P45378 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNNT3P45378 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNNT3P45378 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNNT3P45378 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNNT3P45378 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNNT3P45378 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNNT3P45378 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TNNT3P45378 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNNT3P45378 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNNT3P45378 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNNT3P45378 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TNNT3P45378 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNNT3P45378 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNNT3P45378 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNNT3P45378 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNNT3P45378 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNNT3P45378 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNNT3P45378 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNNT3P45378 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNNT3P45378 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TNNT3P45378 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TNNT3P45378 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TNNT3P45378 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TNNT3P45378 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TNNT3P45378 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TNNT3P45378 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNNT3P45378 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNNT3P45378 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNNT3P45378 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNNT3P45378 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNNT3P45378 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TNNT3P45378 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNNT3P45378 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNNT3P45378 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNNT3P45378 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNNT3P45378 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNNT3P45378 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNNT3P45378 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNNT3P45378 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNNT3P45378 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNNT3P45378 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNNT3P45378 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNNT3P45378 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNNT3P45378 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNNT3P45378 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNNT3P45378 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNNT3P45378 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNNT3P45378 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNNT3P45378 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNNT3P45378 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNNT3P45378 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNNT3P45378 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNNT3P45378 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNNT3P45378 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNNT3P45378 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNNT3P45378 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNNT3P45378 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNNT3P45378 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNNT3P45378 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNNT3P45378 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNNT3P45378 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNNT3P45378 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNNT3P45378 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNNT3P45378 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNNT3P45378 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNNT3P45378 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNNT3P45378 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TNNT3P45378 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNNT3P45378 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNNT3P45378 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNNT3P45378 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNNT3P45378 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNNT3P45378 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNNT3P45378 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNNT3P45378 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNNT3P45378 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNNT3P45378 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNNT3P45378 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNNT3P45378 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNNT3P45378 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNNT3P45378 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNNT3P45378 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNNT3P45378 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNNT3P45378 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNNT3P45378 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNNT3P45378 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms