Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARL1P40616 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARL1P40616 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARL1P40616 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARL1P40616 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARL1P40616 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARL1P40616 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARL1P40616 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARL1P40616 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARL1P40616 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARL1P40616 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARL1P40616 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARL1P40616 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARL1P40616 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARL1P40616 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARL1P40616 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARL1P40616 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ARL1P40616 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARL1P40616 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARL1P40616 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARL1P40616 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARL1P40616 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARL1P40616 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARL1P40616 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARL1P40616 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARL1P40616 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARL1P40616 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARL1P40616 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARL1P40616 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARL1P40616 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARL1P40616 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARL1P40616 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARL1P40616 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARL1P40616 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARL1P40616 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARL1P40616 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARL1P40616 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARL1P40616 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARL1P40616 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARL1P40616 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARL1P40616 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARL1P40616 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARL1P40616 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARL1P40616 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARL1P40616 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARL1P40616 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARL1P40616 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARL1P40616 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARL1P40616 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARL1P40616 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARL1P40616 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARL1P40616 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARL1P40616 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARL1P40616 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARL1P40616 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARL1P40616 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ARL1P40616 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARL1P40616 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ARL1P40616 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ARL1P40616 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARL1P40616 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARL1P40616 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
ARL1P40616 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
ARL1P40616 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ARL1P40616 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ARL1P40616 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ARL1P40616 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ARL1P40616 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARL1P40616 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARL1P40616 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARL1P40616 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARL1P40616 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARL1P40616 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ARL1P40616 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARL1P40616 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARL1P40616 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARL1P40616 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARL1P40616 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARL1P40616 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARL1P40616 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARL1P40616 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARL1P40616 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARL1P40616 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARL1P40616 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARL1P40616 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARL1P40616 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARL1P40616 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARL1P40616 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARL1P40616 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARL1P40616 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARL1P40616 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARL1P40616 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARL1P40616 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARL1P40616 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARL1P40616 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARL1P40616 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARL1P40616 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARL1P40616 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARL1P40616 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARL1P40616 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms