Protein–RNA interactions for Protein: P40105

YRF1-2, Y' element ATP-dependent helicase protein 1 copy 2, yeastyeast

Predictions only

Length 1,681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YRF1-2P40105 BIT61YJL058C 1632 nt0.8□□□□□ -2.28
YRF1-2P40105 TAN1YGL232W 870 nt0.8□□□□□ -2.28
YRF1-2P40105 YLR307C-AYLR307C-A 264 nt0.8□□□□□ -2.28
YRF1-2P40105 SEC63YOR254C 1992 nt0.8□□□□□ -2.28
YRF1-2P40105 UBP11YKR098C 2154 nt0.79□□□□□ -2.28
YRF1-2P40105 YDL026WYDL026W 312 nt0.79□□□□□ -2.28
YRF1-2P40105 NYV1YLR093C 762 nt0.79□□□□□ -2.28
YRF1-2P40105 YLR290CYLR290C 834 nt0.79□□□□□ -2.28
YRF1-2P40105 YLR444CYLR444C 303 nt0.79□□□□□ -2.28
YRF1-2P40105 RPS18BYML026C 441 nt0.79□□□□□ -2.28
YRF1-2P40105 YMR181CYMR181C 465 nt0.79□□□□□ -2.28
YRF1-2P40105 DYN3YMR299C 939 nt0.79□□□□□ -2.28
YRF1-2P40105 ATP16YDL004W 483 nt0.78□□□□□ -2.28
YRF1-2P40105 COBQ0105 1158 nt0.78□□□□□ -2.28
YRF1-2P40105 EPT1YHR123W 1176 nt0.78□□□□□ -2.28
YRF1-2P40105 MRP49YKL167C 414 nt0.78□□□□□ -2.28
YRF1-2P40105 SRN2YLR119W 642 nt0.78□□□□□ -2.28
YRF1-2P40105 PRM6YML047C 1059 nt0.78□□□□□ -2.28
YRF1-2P40105 YLR149CYLR149C 2193 nt0.78□□□□□ -2.28
YRF1-2P40105 SEC8YPR055W 3198 nt0.78□□□□□ -2.28
YRF1-2P40105 MUB1YMR100W 1863 nt0.78□□□□□ -2.29
YRF1-2P40105 YIM2YMR151W 438 nt0.78□□□□□ -2.29
YRF1-2P40105 YBR277CYBR277C 402 nt0.78□□□□□ -2.29
YRF1-2P40105 PAF1YBR279W 1338 nt0.78□□□□□ -2.29
YRF1-2P40105 HMI1YOL095C 2121 nt0.77□□□□□ -2.29
YRF1-2P40105 SHU2YDR078C 672 nt0.77□□□□□ -2.29
YRF1-2P40105 ECM11YDR446W 909 nt0.77□□□□□ -2.29
YRF1-2P40105 YIL161WYIL161W 708 nt0.77□□□□□ -2.29
YRF1-2P40105 ATG10YLL042C 504 nt0.77□□□□□ -2.29
YRF1-2P40105 YOR152CYOR152C 771 nt0.77□□□□□ -2.29
YRF1-2P40105 MNE1YOR350C 1992 nt0.77□□□□□ -2.29
YRF1-2P40105 PRP39YML046W 1890 nt0.77□□□□□ -2.29
YRF1-2P40105 YEA4YEL004W 1029 nt0.76□□□□□ -2.29
YRF1-2P40105 YER189WYER189W 369 nt0.76□□□□□ -2.29
YRF1-2P40105 YMR099CYMR099C 894 nt0.76□□□□□ -2.29
YRF1-2P40105 NGL1YOL042W 1092 nt0.76□□□□□ -2.29
YRF1-2P40105 TOA1YOR194C 861 nt0.76□□□□□ -2.29
YRF1-2P40105 CUP9YPL177C 921 nt0.76□□□□□ -2.29
YRF1-2P40105 YPR145C-AYPR145C-A 237 nt0.76□□□□□ -2.29
YRF1-2P40105 HIR3YJR140C 4947 nt0.76□□□□□ -2.29
YRF1-2P40105 CIC1YHR052W 1131 nt0.75□□□□□ -2.29
YRF1-2P40105 SVP26YHR181W 687 nt0.75□□□□□ -2.29
YRF1-2P40105 YLR169WYLR169W 354 nt0.75□□□□□ -2.29
YRF1-2P40105 RXT2YBR095C 1293 nt0.75□□□□□ -2.29
YRF1-2P40105 ARK1YNL020C 1917 nt0.75□□□□□ -2.29
YRF1-2P40105 YGR290WYGR290W 444 nt0.75□□□□□ -2.29
YRF1-2P40105 PET123YOR158W 957 nt0.75□□□□□ -2.29
YRF1-2P40105 SEC1YDR164C 2175 nt0.74□□□□□ -2.29
YRF1-2P40105 RRG1YDR065W 1098 nt0.74□□□□□ -2.29
YRF1-2P40105 YGR114CYGR114C 390 nt0.74□□□□□ -2.29
YRF1-2P40105 YIR036W-AYIR036W-A 402 nt0.74□□□□□ -2.29
YRF1-2P40105 BET5YML077W 480 nt0.74□□□□□ -2.29
YRF1-2P40105 KAP122YGL016W 3246 nt0.73□□□□□ -2.29
YRF1-2P40105 UBC9YDL064W 474 nt0.73□□□□□ -2.29
YRF1-2P40105 YFL041W-AYFL041W-A 192 nt0.73□□□□□ -2.29
YRF1-2P40105 SRL1YOR247W 633 nt0.73□□□□□ -2.29
YRF1-2P40105 SWI6YLR182W 2412 nt0.72□□□□□ -2.29
YRF1-2P40105 YGL138CYGL138C 1038 nt0.72□□□□□ -2.29
YRF1-2P40105 DSE2YHR143W 978 nt0.72□□□□□ -2.29
YRF1-2P40105 FIP1YJR093C 984 nt0.72□□□□□ -2.29
YRF1-2P40105 YLR402WYLR402W 192 nt0.72□□□□□ -2.29
YRF1-2P40105 UAF30YOR295W 687 nt0.72□□□□□ -2.29
YRF1-2P40105 JJJ2YJL162C 1752 nt0.72□□□□□ -2.29
YRF1-2P40105 CRM1YGR218W 3255 nt0.72□□□□□ -2.29
YRF1-2P40105 WHI3YNL197C 1986 nt0.72□□□□□ -2.29
YRF1-2P40105 DIG2YDR480W 972 nt0.72□□□□□ -2.29
YRF1-2P40105 VOA1YGR106C 798 nt0.72□□□□□ -2.29
YRF1-2P40105 RPS10AYOR293W 318 nt0.72□□□□□ -2.29
YRF1-2P40105 PES4YFR023W 1836 nt0.71□□□□□ -2.3
YRF1-2P40105 YHR214W-AYHR214W-A 486 nt0.71□□□□□ -2.3
YRF1-2P40105 TEN1YLR010C 483 nt0.71□□□□□ -2.3
YRF1-2P40105 YAR068WYAR068W 486 nt0.71□□□□□ -2.3
YRF1-2P40105 CSE1YGL238W 2883 nt0.71□□□□□ -2.3
YRF1-2P40105 YNL034WYNL034W 1839 nt0.7□□□□□ -2.3
YRF1-2P40105 YDL062WYDL062W 426 nt0.7□□□□□ -2.3
YRF1-2P40105 NBL1YHR199C-A 222 nt0.7□□□□□ -2.3
YRF1-2P40105 SRL4YPL033C 846 nt0.7□□□□□ -2.3
YRF1-2P40105 UPF3YGR072W 1164 nt0.69□□□□□ -2.3
YRF1-2P40105 CTR9YOL145C 3234 nt0.69□□□□□ -2.3
YRF1-2P40105 YCR108CYCR108C 192 nt0.69□□□□□ -2.3
YRF1-2P40105 FIG1YBR040W 897 nt0.69□□□□□ -2.3
YRF1-2P40105 snR191snR191 274 nt0.69□□□□□ -2.3
YRF1-2P40105 SHS1YDL225W 1656 nt0.68□□□□□ -2.3
YRF1-2P40105 YML002WYML002W 2214 nt0.68□□□□□ -2.3
YRF1-2P40105 REX3YLR107W 1215 nt0.68□□□□□ -2.3
YRF1-2P40105 ATG38YLR211C 681 nt0.68□□□□□ -2.3
YRF1-2P40105 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt0.68□□□□□ -2.3
YRF1-2P40105 GIM3YNL153C 390 nt0.68□□□□□ -2.3
YRF1-2P40105 YBL094CYBL094C 333 nt0.68□□□□□ -2.3
YRF1-2P40105 PCL2YDL127W 927 nt0.67□□□□□ -2.3
YRF1-2P40105 DSE1YER124C 1722 nt0.66□□□□□ -2.3
YRF1-2P40105 NOP53YPL146C 1368 nt0.66□□□□□ -2.3
YRF1-2P40105 SLK19YOR195W 2466 nt0.66□□□□□ -2.3
YRF1-2P40105 YIL089WYIL089W 618 nt0.65□□□□□ -2.3
YRF1-2P40105 YCL001W-AYCL001W-A 462 nt0.65□□□□□ -2.3
YRF1-2P40105 YHL012WYHL012W 1482 nt0.64□□□□□ -2.31
YRF1-2P40105 MTC7YEL033W 420 nt0.64□□□□□ -2.31
YRF1-2P40105 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt0.64□□□□□ -2.31
YRF1-2P40105 SRP21YKL122C 504 nt0.64□□□□□ -2.31
YRF1-2P40105 RPL6BYLR448W 531 nt0.64□□□□□ -2.31
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 41.7 ms