Protein–RNA interactions for Protein: P35749

MYH11, Myosin-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,972 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH11P35749 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYH11P35749 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYH11P35749 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYH11P35749 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYH11P35749 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYH11P35749 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYH11P35749 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYH11P35749 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYH11P35749 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYH11P35749 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYH11P35749 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYH11P35749 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYH11P35749 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYH11P35749 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYH11P35749 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYH11P35749 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MYH11P35749 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MYH11P35749 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MYH11P35749 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MYH11P35749 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MYH11P35749 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MYH11P35749 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MYH11P35749 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MYH11P35749 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MYH11P35749 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MYH11P35749 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MYH11P35749 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MYH11P35749 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MYH11P35749 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MYH11P35749 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MYH11P35749 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MYH11P35749 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MYH11P35749 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MYH11P35749 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYH11P35749 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYH11P35749 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYH11P35749 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYH11P35749 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYH11P35749 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYH11P35749 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYH11P35749 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYH11P35749 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYH11P35749 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYH11P35749 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYH11P35749 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MYH11P35749 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYH11P35749 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYH11P35749 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYH11P35749 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYH11P35749 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYH11P35749 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYH11P35749 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYH11P35749 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MYH11P35749 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MYH11P35749 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MYH11P35749 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MYH11P35749 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MYH11P35749 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MYH11P35749 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MYH11P35749 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MYH11P35749 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MYH11P35749 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MYH11P35749 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MYH11P35749 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MYH11P35749 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MYH11P35749 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MYH11P35749 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MYH11P35749 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MYH11P35749 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MYH11P35749 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MYH11P35749 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MYH11P35749 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MYH11P35749 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MYH11P35749 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MYH11P35749 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MYH11P35749 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MYH11P35749 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MYH11P35749 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MYH11P35749 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MYH11P35749 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MYH11P35749 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MYH11P35749 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MYH11P35749 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MYH11P35749 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MYH11P35749 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MYH11P35749 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MYH11P35749 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MYH11P35749 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MYH11P35749 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MYH11P35749 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MYH11P35749 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MYH11P35749 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MYH11P35749 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MYH11P35749 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MYH11P35749 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MYH11P35749 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MYH11P35749 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MYH11P35749 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MYH11P35749 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MYH11P35749 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms