Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
ABCC1P33527 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ABCC1P33527 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
ABCC1P33527 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ABCC1P33527 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
ABCC1P33527 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
ABCC1P33527 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
ABCC1P33527 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ABCC1P33527 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
ABCC1P33527 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ABCC1P33527 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ABCC1P33527 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ABCC1P33527 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ABCC1P33527 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ABCC1P33527 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
ABCC1P33527 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ABCC1P33527 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ABCC1P33527 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
ABCC1P33527 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
ABCC1P33527 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
ABCC1P33527 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
ABCC1P33527 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ABCC1P33527 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ABCC1P33527 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ABCC1P33527 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ABCC1P33527 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ABCC1P33527 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
ABCC1P33527 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
ABCC1P33527 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ABCC1P33527 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
ABCC1P33527 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
ABCC1P33527 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
ABCC1P33527 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
ABCC1P33527 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC30.92■■■□□ 2.54
ABCC1P33527 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
ABCC1P33527 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
ABCC1P33527 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ABCC1P33527 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ABCC1P33527 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ABCC1P33527 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
ABCC1P33527 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
ABCC1P33527 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
ABCC1P33527 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
ABCC1P33527 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
ABCC1P33527 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
ABCC1P33527 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
ABCC1P33527 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
ABCC1P33527 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
ABCC1P33527 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
ABCC1P33527 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC30.91■■■□□ 2.54
ABCC1P33527 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
ABCC1P33527 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
ABCC1P33527 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
ABCC1P33527 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
ABCC1P33527 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
ABCC1P33527 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
ABCC1P33527 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
ABCC1P33527 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
ABCC1P33527 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
ABCC1P33527 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
ABCC1P33527 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
ABCC1P33527 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
ABCC1P33527 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
ABCC1P33527 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
ABCC1P33527 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
ABCC1P33527 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
ABCC1P33527 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
ABCC1P33527 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC30.89■■■□□ 2.54
ABCC1P33527 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
ABCC1P33527 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
ABCC1P33527 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
ABCC1P33527 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
ABCC1P33527 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
ABCC1P33527 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
ABCC1P33527 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
ABCC1P33527 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
ABCC1P33527 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
ABCC1P33527 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
ABCC1P33527 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
ABCC1P33527 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
ABCC1P33527 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
ABCC1P33527 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
ABCC1P33527 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
ABCC1P33527 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
ABCC1P33527 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
ABCC1P33527 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
ABCC1P33527 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
ABCC1P33527 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
ABCC1P33527 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
ABCC1P33527 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
ABCC1P33527 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
ABCC1P33527 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
ABCC1P33527 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
ABCC1P33527 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
ABCC1P33527 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
ABCC1P33527 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
ABCC1P33527 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
ABCC1P33527 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
ABCC1P33527 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
ABCC1P33527 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms