Protein–RNA interactions for Protein: P32929

CTH, Cystathionine gamma-lyase, humanhuman

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTHP32929 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTHP32929 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTHP32929 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTHP32929 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTHP32929 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTHP32929 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTHP32929 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTHP32929 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTHP32929 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTHP32929 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTHP32929 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTHP32929 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTHP32929 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTHP32929 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTHP32929 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTHP32929 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTHP32929 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTHP32929 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTHP32929 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTHP32929 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTHP32929 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTHP32929 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTHP32929 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTHP32929 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTHP32929 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTHP32929 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTHP32929 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTHP32929 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTHP32929 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTHP32929 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTHP32929 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTHP32929 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTHP32929 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CTHP32929 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTHP32929 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTHP32929 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTHP32929 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTHP32929 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTHP32929 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTHP32929 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTHP32929 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTHP32929 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTHP32929 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTHP32929 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTHP32929 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTHP32929 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTHP32929 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTHP32929 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTHP32929 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTHP32929 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTHP32929 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTHP32929 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTHP32929 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CTHP32929 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTHP32929 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTHP32929 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTHP32929 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTHP32929 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTHP32929 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTHP32929 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTHP32929 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTHP32929 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTHP32929 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTHP32929 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTHP32929 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CTHP32929 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CTHP32929 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CTHP32929 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTHP32929 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTHP32929 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTHP32929 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTHP32929 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTHP32929 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CTHP32929 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTHP32929 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTHP32929 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CTHP32929 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CTHP32929 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTHP32929 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTHP32929 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTHP32929 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTHP32929 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTHP32929 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTHP32929 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTHP32929 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTHP32929 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTHP32929 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTHP32929 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTHP32929 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTHP32929 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTHP32929 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTHP32929 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTHP32929 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTHP32929 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CTHP32929 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTHP32929 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTHP32929 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTHP32929 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTHP32929 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTHP32929 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms