Protein–RNA interactions for Protein: P31941

APOBEC3A, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3AP31941 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBEC3AP31941 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms