Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HMGB2P26583 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HMGB2P26583 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HMGB2P26583 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HMGB2P26583 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HMGB2P26583 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
HMGB2P26583 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HMGB2P26583 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HMGB2P26583 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HMGB2P26583 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HMGB2P26583 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HMGB2P26583 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HMGB2P26583 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HMGB2P26583 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
HMGB2P26583 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
HMGB2P26583 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
HMGB2P26583 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HMGB2P26583 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC26■■□□□ 1.75
HMGB2P26583 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HMGB2P26583 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
HMGB2P26583 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HMGB2P26583 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HMGB2P26583 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HMGB2P26583 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HMGB2P26583 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HMGB2P26583 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HMGB2P26583 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HMGB2P26583 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HMGB2P26583 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HMGB2P26583 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
HMGB2P26583 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HMGB2P26583 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HMGB2P26583 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HMGB2P26583 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HMGB2P26583 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HMGB2P26583 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HMGB2P26583 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HMGB2P26583 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HMGB2P26583 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HMGB2P26583 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HMGB2P26583 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HMGB2P26583 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HMGB2P26583 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HMGB2P26583 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HMGB2P26583 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HMGB2P26583 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HMGB2P26583 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HMGB2P26583 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HMGB2P26583 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
HMGB2P26583 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HMGB2P26583 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
HMGB2P26583 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HMGB2P26583 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HMGB2P26583 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HMGB2P26583 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HMGB2P26583 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HMGB2P26583 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HMGB2P26583 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HMGB2P26583 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HMGB2P26583 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HMGB2P26583 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HMGB2P26583 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HMGB2P26583 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HMGB2P26583 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
HMGB2P26583 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HMGB2P26583 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HMGB2P26583 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
HMGB2P26583 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HMGB2P26583 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HMGB2P26583 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HMGB2P26583 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HMGB2P26583 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HMGB2P26583 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HMGB2P26583 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HMGB2P26583 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HMGB2P26583 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
HMGB2P26583 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
HMGB2P26583 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HMGB2P26583 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HMGB2P26583 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HMGB2P26583 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HMGB2P26583 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HMGB2P26583 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HMGB2P26583 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HMGB2P26583 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HMGB2P26583 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HMGB2P26583 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HMGB2P26583 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HMGB2P26583 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HMGB2P26583 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HMGB2P26583 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
HMGB2P26583 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
HMGB2P26583 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HMGB2P26583 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HMGB2P26583 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HMGB2P26583 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HMGB2P26583 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HMGB2P26583 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HMGB2P26583 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HMGB2P26583 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms