Protein–RNA interactions for Protein: P19256

CD58, Lymphocyte function-associated antigen 3, humanhuman

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD58P19256 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD58P19256 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD58P19256 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD58P19256 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD58P19256 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD58P19256 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD58P19256 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CD58P19256 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CD58P19256 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CD58P19256 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD58P19256 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD58P19256 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD58P19256 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD58P19256 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD58P19256 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD58P19256 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD58P19256 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD58P19256 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD58P19256 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD58P19256 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD58P19256 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD58P19256 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD58P19256 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD58P19256 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD58P19256 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD58P19256 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD58P19256 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD58P19256 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD58P19256 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD58P19256 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD58P19256 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD58P19256 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD58P19256 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD58P19256 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD58P19256 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD58P19256 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD58P19256 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CD58P19256 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD58P19256 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD58P19256 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD58P19256 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD58P19256 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD58P19256 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD58P19256 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD58P19256 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD58P19256 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CD58P19256 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD58P19256 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CD58P19256 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD58P19256 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD58P19256 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD58P19256 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD58P19256 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CD58P19256 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD58P19256 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CD58P19256 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
CD58P19256 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CD58P19256 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CD58P19256 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CD58P19256 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CD58P19256 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CD58P19256 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CD58P19256 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CD58P19256 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CD58P19256 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CD58P19256 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CD58P19256 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CD58P19256 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CD58P19256 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CD58P19256 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CD58P19256 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CD58P19256 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CD58P19256 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CD58P19256 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD58P19256 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD58P19256 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD58P19256 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD58P19256 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD58P19256 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD58P19256 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD58P19256 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD58P19256 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD58P19256 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD58P19256 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD58P19256 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CD58P19256 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD58P19256 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD58P19256 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD58P19256 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD58P19256 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CD58P19256 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD58P19256 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD58P19256 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD58P19256 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD58P19256 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD58P19256 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD58P19256 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD58P19256 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD58P19256 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD58P19256 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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