Protein–RNA interactions for Protein: P16070

CD44, CD44 antigen, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD44P16070 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD44P16070 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD44P16070 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD44P16070 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD44P16070 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD44P16070 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD44P16070 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD44P16070 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD44P16070 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD44P16070 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD44P16070 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD44P16070 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD44P16070 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD44P16070 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD44P16070 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD44P16070 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD44P16070 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD44P16070 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CD44P16070 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD44P16070 Metazoa_SRP.67-201ENST00000617099 296 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CD44P16070 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD44P16070 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD44P16070 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD44P16070 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD44P16070 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD44P16070 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD44P16070 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD44P16070 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD44P16070 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CD44P16070 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CD44P16070 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CD44P16070 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CD44P16070 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD44P16070 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD44P16070 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD44P16070 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD44P16070 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD44P16070 STK33P1-201ENST00000423835 1218 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CD44P16070 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD44P16070 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD44P16070 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD44P16070 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD44P16070 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD44P16070 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD44P16070 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD44P16070 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD44P16070 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD44P16070 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD44P16070 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD44P16070 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD44P16070 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD44P16070 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD44P16070 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD44P16070 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD44P16070 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD44P16070 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD44P16070 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CD44P16070 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CD44P16070 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD44P16070 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD44P16070 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD44P16070 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD44P16070 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD44P16070 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD44P16070 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CD44P16070 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD44P16070 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD44P16070 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD44P16070 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD44P16070 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD44P16070 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD44P16070 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD44P16070 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD44P16070 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD44P16070 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD44P16070 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CD44P16070 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD44P16070 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD44P16070 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD44P16070 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD44P16070 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD44P16070 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD44P16070 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD44P16070 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD44P16070 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD44P16070 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD44P16070 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD44P16070 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD44P16070 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD44P16070 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD44P16070 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD44P16070 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD44P16070 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD44P16070 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD44P16070 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD44P16070 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD44P16070 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD44P16070 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD44P16070 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD44P16070 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms