Protein–RNA interactions for Protein: P15692

VEGFA, Vascular endothelial growth factor A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFAP15692 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VEGFAP15692 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VEGFAP15692 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VEGFAP15692 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VEGFAP15692 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VEGFAP15692 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VEGFAP15692 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VEGFAP15692 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VEGFAP15692 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VEGFAP15692 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
VEGFAP15692 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VEGFAP15692 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VEGFAP15692 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VEGFAP15692 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VEGFAP15692 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VEGFAP15692 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VEGFAP15692 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VEGFAP15692 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VEGFAP15692 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VEGFAP15692 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VEGFAP15692 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VEGFAP15692 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VEGFAP15692 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VEGFAP15692 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VEGFAP15692 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
VEGFAP15692 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VEGFAP15692 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VEGFAP15692 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VEGFAP15692 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VEGFAP15692 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VEGFAP15692 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VEGFAP15692 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VEGFAP15692 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VEGFAP15692 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VEGFAP15692 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VEGFAP15692 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VEGFAP15692 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VEGFAP15692 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VEGFAP15692 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VEGFAP15692 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
VEGFAP15692 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VEGFAP15692 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VEGFAP15692 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VEGFAP15692 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VEGFAP15692 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VEGFAP15692 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VEGFAP15692 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VEGFAP15692 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VEGFAP15692 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VEGFAP15692 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VEGFAP15692 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VEGFAP15692 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VEGFAP15692 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VEGFAP15692 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VEGFAP15692 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VEGFAP15692 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VEGFAP15692 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VEGFAP15692 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VEGFAP15692 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VEGFAP15692 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VEGFAP15692 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
VEGFAP15692 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VEGFAP15692 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VEGFAP15692 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VEGFAP15692 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VEGFAP15692 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VEGFAP15692 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VEGFAP15692 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VEGFAP15692 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VEGFAP15692 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VEGFAP15692 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
VEGFAP15692 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
VEGFAP15692 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
VEGFAP15692 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
VEGFAP15692 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
VEGFAP15692 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
VEGFAP15692 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
VEGFAP15692 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
VEGFAP15692 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
VEGFAP15692 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
VEGFAP15692 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
VEGFAP15692 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
VEGFAP15692 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
VEGFAP15692 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VEGFAP15692 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VEGFAP15692 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
VEGFAP15692 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VEGFAP15692 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VEGFAP15692 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VEGFAP15692 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VEGFAP15692 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VEGFAP15692 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VEGFAP15692 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VEGFAP15692 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VEGFAP15692 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
VEGFAP15692 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VEGFAP15692 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
VEGFAP15692 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VEGFAP15692 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
VEGFAP15692 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms