Protein–RNA interactions for Protein: P15085

CPA1, Carboxypeptidase A1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA1P15085 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CPA1P15085 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CPA1P15085 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CPA1P15085 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CPA1P15085 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CPA1P15085 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CPA1P15085 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CPA1P15085 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CPA1P15085 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CPA1P15085 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CPA1P15085 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CPA1P15085 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CPA1P15085 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CPA1P15085 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CPA1P15085 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CPA1P15085 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CPA1P15085 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CPA1P15085 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CPA1P15085 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CPA1P15085 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CPA1P15085 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CPA1P15085 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CPA1P15085 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CPA1P15085 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CPA1P15085 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CPA1P15085 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CPA1P15085 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CPA1P15085 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CPA1P15085 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CPA1P15085 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CPA1P15085 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CPA1P15085 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CPA1P15085 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CPA1P15085 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CPA1P15085 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CPA1P15085 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CPA1P15085 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CPA1P15085 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CPA1P15085 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CPA1P15085 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CPA1P15085 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CPA1P15085 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CPA1P15085 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CPA1P15085 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CPA1P15085 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CPA1P15085 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CPA1P15085 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CPA1P15085 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CPA1P15085 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CPA1P15085 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CPA1P15085 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CPA1P15085 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
CPA1P15085 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CPA1P15085 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CPA1P15085 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CPA1P15085 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CPA1P15085 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CPA1P15085 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CPA1P15085 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CPA1P15085 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CPA1P15085 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CPA1P15085 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CPA1P15085 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CPA1P15085 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CPA1P15085 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CPA1P15085 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CPA1P15085 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CPA1P15085 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CPA1P15085 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CPA1P15085 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CPA1P15085 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CPA1P15085 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CPA1P15085 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CPA1P15085 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CPA1P15085 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CPA1P15085 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CPA1P15085 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CPA1P15085 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CPA1P15085 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CPA1P15085 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CPA1P15085 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CPA1P15085 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CPA1P15085 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CPA1P15085 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CPA1P15085 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CPA1P15085 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CPA1P15085 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CPA1P15085 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CPA1P15085 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CPA1P15085 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CPA1P15085 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CPA1P15085 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CPA1P15085 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CPA1P15085 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CPA1P15085 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CPA1P15085 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CPA1P15085 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CPA1P15085 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CPA1P15085 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CPA1P15085 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms