Protein–RNA interactions for Protein: P13805

TNNT1, Troponin T, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1P13805 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNT1P13805 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNT1P13805 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNT1P13805 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNT1P13805 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNT1P13805 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNT1P13805 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNT1P13805 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNT1P13805 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNT1P13805 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNT1P13805 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNT1P13805 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNT1P13805 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNT1P13805 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNT1P13805 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNT1P13805 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNT1P13805 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNT1P13805 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNT1P13805 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNT1P13805 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNT1P13805 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNT1P13805 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNT1P13805 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNT1P13805 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNT1P13805 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNT1P13805 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNT1P13805 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNT1P13805 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNT1P13805 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNT1P13805 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNT1P13805 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNT1P13805 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNT1P13805 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNNT1P13805 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNNT1P13805 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNNT1P13805 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNNT1P13805 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNNT1P13805 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNNT1P13805 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNNT1P13805 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TNNT1P13805 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNNT1P13805 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNNT1P13805 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNNT1P13805 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNNT1P13805 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TNNT1P13805 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TNNT1P13805 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TNNT1P13805 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TNNT1P13805 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TNNT1P13805 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TNNT1P13805 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TNNT1P13805 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNNT1P13805 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNNT1P13805 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNNT1P13805 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNNT1P13805 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNNT1P13805 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNNT1P13805 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNNT1P13805 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNNT1P13805 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNNT1P13805 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNNT1P13805 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNNT1P13805 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNNT1P13805 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNNT1P13805 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNNT1P13805 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNNT1P13805 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNNT1P13805 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNNT1P13805 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNNT1P13805 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNNT1P13805 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNNT1P13805 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNNT1P13805 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNNT1P13805 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TNNT1P13805 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNNT1P13805 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNNT1P13805 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNNT1P13805 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNNT1P13805 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNNT1P13805 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNNT1P13805 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNNT1P13805 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNNT1P13805 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNNT1P13805 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNNT1P13805 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNNT1P13805 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNNT1P13805 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNNT1P13805 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNNT1P13805 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TNNT1P13805 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNNT1P13805 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNNT1P13805 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNNT1P13805 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNNT1P13805 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNNT1P13805 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNNT1P13805 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNNT1P13805 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNNT1P13805 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNNT1P13805 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNNT1P13805 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms