Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGA4P13612 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGA4P13612 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGA4P13612 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGA4P13612 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGA4P13612 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGA4P13612 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGA4P13612 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGA4P13612 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGA4P13612 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGA4P13612 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGA4P13612 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGA4P13612 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGA4P13612 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGA4P13612 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGA4P13612 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGA4P13612 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGA4P13612 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGA4P13612 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGA4P13612 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGA4P13612 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGA4P13612 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGA4P13612 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGA4P13612 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGA4P13612 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGA4P13612 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGA4P13612 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ITGA4P13612 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ITGA4P13612 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ITGA4P13612 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ITGA4P13612 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ITGA4P13612 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ITGA4P13612 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGA4P13612 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGA4P13612 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGA4P13612 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGA4P13612 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGA4P13612 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGA4P13612 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGA4P13612 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGA4P13612 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGA4P13612 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA4P13612 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA4P13612 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA4P13612 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA4P13612 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA4P13612 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA4P13612 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA4P13612 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA4P13612 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA4P13612 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA4P13612 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA4P13612 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA4P13612 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA4P13612 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA4P13612 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA4P13612 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA4P13612 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA4P13612 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA4P13612 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA4P13612 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGA4P13612 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGA4P13612 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGA4P13612 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGA4P13612 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGA4P13612 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGA4P13612 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGA4P13612 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGA4P13612 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGA4P13612 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGA4P13612 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGA4P13612 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGA4P13612 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGA4P13612 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGA4P13612 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGA4P13612 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGA4P13612 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGA4P13612 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGA4P13612 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGA4P13612 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGA4P13612 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGA4P13612 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGA4P13612 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGA4P13612 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGA4P13612 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGA4P13612 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGA4P13612 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGA4P13612 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGA4P13612 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGA4P13612 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGA4P13612 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGA4P13612 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGA4P13612 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGA4P13612 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGA4P13612 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGA4P13612 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGA4P13612 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGA4P13612 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGA4P13612 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGA4P13612 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms