Protein–RNA interactions for Protein: P13501

CCL5, C-C motif chemokine 5, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL5P13501 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCL5P13501 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCL5P13501 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCL5P13501 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCL5P13501 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCL5P13501 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCL5P13501 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCL5P13501 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCL5P13501 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCL5P13501 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCL5P13501 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCL5P13501 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCL5P13501 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCL5P13501 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCL5P13501 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCL5P13501 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCL5P13501 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCL5P13501 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCL5P13501 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCL5P13501 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCL5P13501 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CCL5P13501 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCL5P13501 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCL5P13501 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCL5P13501 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCL5P13501 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCL5P13501 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCL5P13501 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCL5P13501 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCL5P13501 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CCL5P13501 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCL5P13501 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCL5P13501 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCL5P13501 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCL5P13501 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCL5P13501 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCL5P13501 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCL5P13501 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCL5P13501 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCL5P13501 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCL5P13501 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCL5P13501 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCL5P13501 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCL5P13501 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCL5P13501 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCL5P13501 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCL5P13501 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCL5P13501 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCL5P13501 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCL5P13501 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCL5P13501 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCL5P13501 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCL5P13501 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCL5P13501 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCL5P13501 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCL5P13501 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCL5P13501 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCL5P13501 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCL5P13501 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCL5P13501 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCL5P13501 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCL5P13501 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCL5P13501 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCL5P13501 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCL5P13501 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCL5P13501 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCL5P13501 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCL5P13501 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCL5P13501 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCL5P13501 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCL5P13501 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCL5P13501 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCL5P13501 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCL5P13501 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCL5P13501 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCL5P13501 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCL5P13501 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCL5P13501 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCL5P13501 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCL5P13501 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCL5P13501 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCL5P13501 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCL5P13501 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCL5P13501 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCL5P13501 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCL5P13501 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCL5P13501 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCL5P13501 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCL5P13501 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCL5P13501 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCL5P13501 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCL5P13501 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCL5P13501 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCL5P13501 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCL5P13501 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCL5P13501 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCL5P13501 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCL5P13501 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCL5P13501 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCL5P13501 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms