Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DMDP11532 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DMDP11532 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DMDP11532 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DMDP11532 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DMDP11532 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DMDP11532 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
DMDP11532 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DMDP11532 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DMDP11532 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DMDP11532 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DMDP11532 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DMDP11532 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DMDP11532 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DMDP11532 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DMDP11532 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DMDP11532 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DMDP11532 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DMDP11532 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DMDP11532 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DMDP11532 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DMDP11532 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DMDP11532 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DMDP11532 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DMDP11532 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DMDP11532 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DMDP11532 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DMDP11532 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DMDP11532 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DMDP11532 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DMDP11532 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DMDP11532 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DMDP11532 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DMDP11532 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
DMDP11532 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DMDP11532 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DMDP11532 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DMDP11532 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DMDP11532 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DMDP11532 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DMDP11532 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DMDP11532 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DMDP11532 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DMDP11532 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DMDP11532 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DMDP11532 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DMDP11532 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DMDP11532 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DMDP11532 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DMDP11532 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DMDP11532 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DMDP11532 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DMDP11532 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
DMDP11532 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
DMDP11532 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DMDP11532 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DMDP11532 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DMDP11532 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DMDP11532 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DMDP11532 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DMDP11532 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DMDP11532 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DMDP11532 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DMDP11532 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
DMDP11532 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DMDP11532 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DMDP11532 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DMDP11532 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DMDP11532 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DMDP11532 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DMDP11532 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DMDP11532 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DMDP11532 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DMDP11532 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DMDP11532 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DMDP11532 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
DMDP11532 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DMDP11532 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DMDP11532 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DMDP11532 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DMDP11532 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DMDP11532 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DMDP11532 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
DMDP11532 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DMDP11532 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DMDP11532 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DMDP11532 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DMDP11532 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DMDP11532 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DMDP11532 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DMDP11532 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DMDP11532 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DMDP11532 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DMDP11532 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DMDP11532 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DMDP11532 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DMDP11532 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DMDP11532 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DMDP11532 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DMDP11532 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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