Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
CHGAP10645 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CHGAP10645 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CHGAP10645 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
CHGAP10645 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CHGAP10645 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CHGAP10645 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CHGAP10645 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CHGAP10645 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
CHGAP10645 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
CHGAP10645 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CHGAP10645 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CHGAP10645 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CHGAP10645 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CHGAP10645 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CHGAP10645 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CHGAP10645 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CHGAP10645 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CHGAP10645 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CHGAP10645 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CHGAP10645 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CHGAP10645 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CHGAP10645 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
CHGAP10645 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CHGAP10645 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
CHGAP10645 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CHGAP10645 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CHGAP10645 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CHGAP10645 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CHGAP10645 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CHGAP10645 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CHGAP10645 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CHGAP10645 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CHGAP10645 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CHGAP10645 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CHGAP10645 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
CHGAP10645 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CHGAP10645 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CHGAP10645 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CHGAP10645 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CHGAP10645 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CHGAP10645 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CHGAP10645 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CHGAP10645 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CHGAP10645 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CHGAP10645 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
CHGAP10645 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CHGAP10645 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CHGAP10645 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CHGAP10645 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CHGAP10645 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
CHGAP10645 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CHGAP10645 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CHGAP10645 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CHGAP10645 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CHGAP10645 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CHGAP10645 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CHGAP10645 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CHGAP10645 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CHGAP10645 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CHGAP10645 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CHGAP10645 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CHGAP10645 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CHGAP10645 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CHGAP10645 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CHGAP10645 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CHGAP10645 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CHGAP10645 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CHGAP10645 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CHGAP10645 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CHGAP10645 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CHGAP10645 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CHGAP10645 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
CHGAP10645 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CHGAP10645 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CHGAP10645 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CHGAP10645 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CHGAP10645 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CHGAP10645 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CHGAP10645 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CHGAP10645 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CHGAP10645 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CHGAP10645 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CHGAP10645 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CHGAP10645 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CHGAP10645 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CHGAP10645 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CHGAP10645 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CHGAP10645 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CHGAP10645 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CHGAP10645 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CHGAP10645 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CHGAP10645 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CHGAP10645 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CHGAP10645 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CHGAP10645 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CHGAP10645 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CHGAP10645 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CHGAP10645 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CHGAP10645 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms