Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD0

RGPD1, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD1P0DJD0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RGPD1P0DJD0 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
RGPD1P0DJD0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RGPD1P0DJD0 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RGPD1P0DJD0 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RGPD1P0DJD0 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RGPD1P0DJD0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RGPD1P0DJD0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RGPD1P0DJD0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RGPD1P0DJD0 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RGPD1P0DJD0 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RGPD1P0DJD0 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RGPD1P0DJD0 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RGPD1P0DJD0 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RGPD1P0DJD0 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RGPD1P0DJD0 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RGPD1P0DJD0 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RGPD1P0DJD0 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RGPD1P0DJD0 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RGPD1P0DJD0 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RGPD1P0DJD0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RGPD1P0DJD0 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RGPD1P0DJD0 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RGPD1P0DJD0 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RGPD1P0DJD0 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RGPD1P0DJD0 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RGPD1P0DJD0 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RGPD1P0DJD0 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RGPD1P0DJD0 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RGPD1P0DJD0 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RGPD1P0DJD0 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RGPD1P0DJD0 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RGPD1P0DJD0 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RGPD1P0DJD0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RGPD1P0DJD0 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RGPD1P0DJD0 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RGPD1P0DJD0 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
RGPD1P0DJD0 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RGPD1P0DJD0 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RGPD1P0DJD0 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
RGPD1P0DJD0 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RGPD1P0DJD0 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RGPD1P0DJD0 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RGPD1P0DJD0 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RGPD1P0DJD0 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RGPD1P0DJD0 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RGPD1P0DJD0 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
RGPD1P0DJD0 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RGPD1P0DJD0 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RGPD1P0DJD0 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RGPD1P0DJD0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RGPD1P0DJD0 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RGPD1P0DJD0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
RGPD1P0DJD0 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
RGPD1P0DJD0 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RGPD1P0DJD0 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RGPD1P0DJD0 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
RGPD1P0DJD0 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RGPD1P0DJD0 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RGPD1P0DJD0 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RGPD1P0DJD0 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RGPD1P0DJD0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RGPD1P0DJD0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RGPD1P0DJD0 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RGPD1P0DJD0 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RGPD1P0DJD0 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RGPD1P0DJD0 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RGPD1P0DJD0 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RGPD1P0DJD0 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RGPD1P0DJD0 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RGPD1P0DJD0 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RGPD1P0DJD0 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RGPD1P0DJD0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RGPD1P0DJD0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RGPD1P0DJD0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
RGPD1P0DJD0 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RGPD1P0DJD0 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RGPD1P0DJD0 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RGPD1P0DJD0 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RGPD1P0DJD0 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RGPD1P0DJD0 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
RGPD1P0DJD0 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RGPD1P0DJD0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RGPD1P0DJD0 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RGPD1P0DJD0 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RGPD1P0DJD0 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RGPD1P0DJD0 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RGPD1P0DJD0 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RGPD1P0DJD0 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RGPD1P0DJD0 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RGPD1P0DJD0 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RGPD1P0DJD0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RGPD1P0DJD0 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RGPD1P0DJD0 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RGPD1P0DJD0 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RGPD1P0DJD0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RGPD1P0DJD0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RGPD1P0DJD0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RGPD1P0DJD0 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RGPD1P0DJD0 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms