Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC166P0CW27 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC166P0CW27 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC166P0CW27 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC166P0CW27 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC166P0CW27 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC166P0CW27 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC166P0CW27 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC166P0CW27 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC166P0CW27 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC166P0CW27 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC166P0CW27 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC166P0CW27 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC166P0CW27 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC166P0CW27 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC166P0CW27 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC166P0CW27 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC166P0CW27 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC166P0CW27 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC166P0CW27 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC166P0CW27 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC166P0CW27 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC166P0CW27 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC166P0CW27 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC166P0CW27 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC166P0CW27 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC166P0CW27 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC166P0CW27 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC166P0CW27 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC166P0CW27 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC166P0CW27 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC166P0CW27 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC166P0CW27 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC166P0CW27 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC166P0CW27 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC166P0CW27 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC166P0CW27 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC166P0CW27 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC166P0CW27 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC166P0CW27 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC166P0CW27 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC166P0CW27 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC166P0CW27 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC166P0CW27 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC166P0CW27 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC166P0CW27 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC166P0CW27 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC166P0CW27 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC166P0CW27 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC166P0CW27 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC166P0CW27 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC166P0CW27 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC166P0CW27 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC166P0CW27 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC166P0CW27 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC166P0CW27 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC166P0CW27 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC166P0CW27 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC166P0CW27 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC166P0CW27 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC166P0CW27 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC166P0CW27 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC166P0CW27 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC166P0CW27 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC166P0CW27 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC166P0CW27 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC166P0CW27 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC166P0CW27 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC166P0CW27 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC166P0CW27 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC166P0CW27 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC166P0CW27 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC166P0CW27 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC166P0CW27 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC166P0CW27 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC166P0CW27 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC166P0CW27 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.83
CCDC166P0CW27 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC166P0CW27 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC166P0CW27 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC166P0CW27 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC166P0CW27 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC166P0CW27 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC166P0CW27 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC166P0CW27 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC166P0CW27 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC166P0CW27 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC166P0CW27 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC166P0CW27 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC166P0CW27 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC166P0CW27 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC166P0CW27 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC166P0CW27 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC166P0CW27 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC166P0CW27 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC166P0CW27 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC166P0CW27 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC166P0CW27 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC166P0CW27 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC166P0CW27 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms