Protein–RNA interactions for Protein: P0C7I0

USP17L8, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L8P0C7I0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP17L8P0C7I0 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP17L8P0C7I0 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP17L8P0C7I0 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP17L8P0C7I0 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP17L8P0C7I0 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP17L8P0C7I0 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP17L8P0C7I0 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
USP17L8P0C7I0 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
USP17L8P0C7I0 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP17L8P0C7I0 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
USP17L8P0C7I0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP17L8P0C7I0 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP17L8P0C7I0 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP17L8P0C7I0 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP17L8P0C7I0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP17L8P0C7I0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP17L8P0C7I0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP17L8P0C7I0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP17L8P0C7I0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP17L8P0C7I0 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP17L8P0C7I0 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP17L8P0C7I0 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP17L8P0C7I0 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP17L8P0C7I0 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP17L8P0C7I0 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP17L8P0C7I0 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP17L8P0C7I0 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
USP17L8P0C7I0 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
USP17L8P0C7I0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP17L8P0C7I0 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP17L8P0C7I0 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP17L8P0C7I0 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP17L8P0C7I0 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP17L8P0C7I0 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP17L8P0C7I0 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP17L8P0C7I0 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP17L8P0C7I0 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP17L8P0C7I0 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP17L8P0C7I0 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP17L8P0C7I0 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP17L8P0C7I0 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP17L8P0C7I0 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
USP17L8P0C7I0 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP17L8P0C7I0 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
USP17L8P0C7I0 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP17L8P0C7I0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP17L8P0C7I0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP17L8P0C7I0 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
USP17L8P0C7I0 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
USP17L8P0C7I0 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
USP17L8P0C7I0 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
USP17L8P0C7I0 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP17L8P0C7I0 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP17L8P0C7I0 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP17L8P0C7I0 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP17L8P0C7I0 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP17L8P0C7I0 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP17L8P0C7I0 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP17L8P0C7I0 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP17L8P0C7I0 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP17L8P0C7I0 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP17L8P0C7I0 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
USP17L8P0C7I0 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP17L8P0C7I0 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP17L8P0C7I0 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP17L8P0C7I0 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
USP17L8P0C7I0 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
USP17L8P0C7I0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP17L8P0C7I0 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP17L8P0C7I0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP17L8P0C7I0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP17L8P0C7I0 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP17L8P0C7I0 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP17L8P0C7I0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP17L8P0C7I0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
USP17L8P0C7I0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP17L8P0C7I0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP17L8P0C7I0 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP17L8P0C7I0 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP17L8P0C7I0 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP17L8P0C7I0 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP17L8P0C7I0 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP17L8P0C7I0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP17L8P0C7I0 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP17L8P0C7I0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP17L8P0C7I0 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP17L8P0C7I0 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP17L8P0C7I0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP17L8P0C7I0 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP17L8P0C7I0 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP17L8P0C7I0 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP17L8P0C7I0 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP17L8P0C7I0 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP17L8P0C7I0 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
USP17L8P0C7I0 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP17L8P0C7I0 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP17L8P0C7I0 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP17L8P0C7I0 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP17L8P0C7I0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
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