Protein–RNA interactions for Protein: P08238

HSP90AB1, Heat shock protein HSP 90-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB1P08238 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HSP90AB1P08238 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HSP90AB1P08238 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HSP90AB1P08238 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HSP90AB1P08238 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HSP90AB1P08238 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HSP90AB1P08238 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HSP90AB1P08238 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HSP90AB1P08238 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HSP90AB1P08238 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HSP90AB1P08238 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HSP90AB1P08238 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HSP90AB1P08238 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HSP90AB1P08238 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HSP90AB1P08238 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HSP90AB1P08238 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HSP90AB1P08238 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HSP90AB1P08238 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HSP90AB1P08238 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HSP90AB1P08238 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HSP90AB1P08238 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HSP90AB1P08238 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HSP90AB1P08238 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HSP90AB1P08238 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HSP90AB1P08238 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HSP90AB1P08238 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
HSP90AB1P08238 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HSP90AB1P08238 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HSP90AB1P08238 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HSP90AB1P08238 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HSP90AB1P08238 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HSP90AB1P08238 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HSP90AB1P08238 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HSP90AB1P08238 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HSP90AB1P08238 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
HSP90AB1P08238 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HSP90AB1P08238 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HSP90AB1P08238 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HSP90AB1P08238 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HSP90AB1P08238 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HSP90AB1P08238 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HSP90AB1P08238 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HSP90AB1P08238 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HSP90AB1P08238 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HSP90AB1P08238 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HSP90AB1P08238 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HSP90AB1P08238 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HSP90AB1P08238 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HSP90AB1P08238 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HSP90AB1P08238 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HSP90AB1P08238 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HSP90AB1P08238 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
HSP90AB1P08238 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.88
HSP90AB1P08238 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HSP90AB1P08238 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HSP90AB1P08238 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HSP90AB1P08238 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HSP90AB1P08238 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HSP90AB1P08238 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HSP90AB1P08238 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HSP90AB1P08238 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HSP90AB1P08238 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HSP90AB1P08238 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HSP90AB1P08238 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HSP90AB1P08238 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HSP90AB1P08238 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HSP90AB1P08238 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HSP90AB1P08238 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HSP90AB1P08238 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HSP90AB1P08238 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HSP90AB1P08238 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HSP90AB1P08238 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HSP90AB1P08238 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HSP90AB1P08238 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HSP90AB1P08238 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HSP90AB1P08238 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HSP90AB1P08238 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HSP90AB1P08238 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HSP90AB1P08238 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HSP90AB1P08238 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HSP90AB1P08238 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HSP90AB1P08238 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HSP90AB1P08238 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HSP90AB1P08238 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HSP90AB1P08238 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HSP90AB1P08238 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HSP90AB1P08238 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HSP90AB1P08238 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HSP90AB1P08238 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HSP90AB1P08238 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HSP90AB1P08238 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HSP90AB1P08238 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HSP90AB1P08238 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HSP90AB1P08238 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HSP90AB1P08238 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
HSP90AB1P08238 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HSP90AB1P08238 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HSP90AB1P08238 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HSP90AB1P08238 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HSP90AB1P08238 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms