Protein–RNA interactions for Protein: P07498

CSN3, Kappa-casein, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN3P07498 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSN3P07498 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSN3P07498 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSN3P07498 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSN3P07498 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSN3P07498 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSN3P07498 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSN3P07498 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSN3P07498 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSN3P07498 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSN3P07498 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSN3P07498 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSN3P07498 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSN3P07498 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSN3P07498 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CSN3P07498 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSN3P07498 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSN3P07498 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSN3P07498 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSN3P07498 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CSN3P07498 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSN3P07498 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CSN3P07498 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSN3P07498 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSN3P07498 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSN3P07498 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSN3P07498 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSN3P07498 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSN3P07498 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSN3P07498 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSN3P07498 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSN3P07498 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSN3P07498 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSN3P07498 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSN3P07498 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSN3P07498 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSN3P07498 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSN3P07498 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSN3P07498 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CSN3P07498 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSN3P07498 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSN3P07498 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSN3P07498 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSN3P07498 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSN3P07498 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSN3P07498 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSN3P07498 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSN3P07498 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSN3P07498 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSN3P07498 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSN3P07498 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CSN3P07498 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSN3P07498 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSN3P07498 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSN3P07498 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSN3P07498 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSN3P07498 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSN3P07498 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSN3P07498 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSN3P07498 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSN3P07498 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSN3P07498 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSN3P07498 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSN3P07498 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSN3P07498 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSN3P07498 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSN3P07498 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CSN3P07498 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSN3P07498 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSN3P07498 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSN3P07498 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSN3P07498 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSN3P07498 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSN3P07498 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSN3P07498 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CSN3P07498 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSN3P07498 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSN3P07498 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSN3P07498 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSN3P07498 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSN3P07498 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSN3P07498 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSN3P07498 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSN3P07498 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSN3P07498 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSN3P07498 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSN3P07498 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSN3P07498 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSN3P07498 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSN3P07498 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSN3P07498 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSN3P07498 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSN3P07498 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSN3P07498 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CSN3P07498 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CSN3P07498 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSN3P07498 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSN3P07498 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSN3P07498 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSN3P07498 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms