Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NEFMP07197 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NEFMP07197 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NEFMP07197 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NEFMP07197 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NEFMP07197 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NEFMP07197 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
NEFMP07197 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NEFMP07197 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NEFMP07197 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NEFMP07197 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NEFMP07197 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NEFMP07197 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
NEFMP07197 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NEFMP07197 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
NEFMP07197 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NEFMP07197 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NEFMP07197 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NEFMP07197 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NEFMP07197 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NEFMP07197 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
NEFMP07197 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NEFMP07197 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NEFMP07197 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NEFMP07197 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NEFMP07197 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
NEFMP07197 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
NEFMP07197 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NEFMP07197 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NEFMP07197 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NEFMP07197 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NEFMP07197 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NEFMP07197 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
NEFMP07197 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
NEFMP07197 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NEFMP07197 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NEFMP07197 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NEFMP07197 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NEFMP07197 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NEFMP07197 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NEFMP07197 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NEFMP07197 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NEFMP07197 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NEFMP07197 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
NEFMP07197 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NEFMP07197 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NEFMP07197 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NEFMP07197 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NEFMP07197 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NEFMP07197 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NEFMP07197 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
NEFMP07197 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NEFMP07197 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NEFMP07197 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NEFMP07197 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NEFMP07197 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NEFMP07197 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NEFMP07197 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NEFMP07197 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NEFMP07197 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NEFMP07197 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NEFMP07197 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NEFMP07197 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NEFMP07197 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
NEFMP07197 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NEFMP07197 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NEFMP07197 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NEFMP07197 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEFMP07197 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEFMP07197 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEFMP07197 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEFMP07197 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEFMP07197 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEFMP07197 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
NEFMP07197 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
NEFMP07197 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEFMP07197 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
NEFMP07197 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEFMP07197 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEFMP07197 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEFMP07197 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEFMP07197 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEFMP07197 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEFMP07197 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEFMP07197 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NEFMP07197 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NEFMP07197 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NEFMP07197 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NEFMP07197 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NEFMP07197 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NEFMP07197 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NEFMP07197 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NEFMP07197 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NEFMP07197 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NEFMP07197 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
NEFMP07197 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NEFMP07197 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
NEFMP07197 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NEFMP07197 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NEFMP07197 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms