Protein–RNA interactions for Protein: P06753

TPM3, Tropomyosin alpha-3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM3P06753 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPM3P06753 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPM3P06753 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPM3P06753 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPM3P06753 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPM3P06753 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPM3P06753 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPM3P06753 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPM3P06753 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPM3P06753 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPM3P06753 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPM3P06753 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPM3P06753 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPM3P06753 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPM3P06753 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPM3P06753 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPM3P06753 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPM3P06753 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPM3P06753 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPM3P06753 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPM3P06753 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TPM3P06753 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPM3P06753 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPM3P06753 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPM3P06753 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPM3P06753 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPM3P06753 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPM3P06753 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPM3P06753 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPM3P06753 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPM3P06753 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPM3P06753 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPM3P06753 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPM3P06753 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPM3P06753 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPM3P06753 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TPM3P06753 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPM3P06753 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPM3P06753 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPM3P06753 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPM3P06753 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPM3P06753 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPM3P06753 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPM3P06753 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPM3P06753 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPM3P06753 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPM3P06753 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPM3P06753 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPM3P06753 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TPM3P06753 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPM3P06753 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPM3P06753 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPM3P06753 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPM3P06753 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPM3P06753 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPM3P06753 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPM3P06753 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TPM3P06753 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPM3P06753 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPM3P06753 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPM3P06753 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPM3P06753 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPM3P06753 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPM3P06753 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPM3P06753 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPM3P06753 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPM3P06753 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TPM3P06753 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPM3P06753 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPM3P06753 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPM3P06753 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPM3P06753 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPM3P06753 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPM3P06753 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPM3P06753 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPM3P06753 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPM3P06753 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPM3P06753 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPM3P06753 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPM3P06753 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPM3P06753 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPM3P06753 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPM3P06753 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPM3P06753 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPM3P06753 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPM3P06753 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TPM3P06753 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPM3P06753 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPM3P06753 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPM3P06753 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPM3P06753 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPM3P06753 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPM3P06753 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPM3P06753 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPM3P06753 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPM3P06753 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TPM3P06753 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPM3P06753 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPM3P06753 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPM3P06753 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms