Protein–RNA interactions for Protein: P06454

PTMA, Prothymosin alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMAP06454 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTMAP06454 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTMAP06454 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTMAP06454 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTMAP06454 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTMAP06454 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTMAP06454 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTMAP06454 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTMAP06454 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTMAP06454 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTMAP06454 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTMAP06454 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTMAP06454 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTMAP06454 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTMAP06454 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTMAP06454 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTMAP06454 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTMAP06454 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTMAP06454 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTMAP06454 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTMAP06454 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTMAP06454 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTMAP06454 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTMAP06454 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTMAP06454 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTMAP06454 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTMAP06454 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTMAP06454 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTMAP06454 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTMAP06454 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTMAP06454 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTMAP06454 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTMAP06454 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTMAP06454 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTMAP06454 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTMAP06454 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTMAP06454 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTMAP06454 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PTMAP06454 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTMAP06454 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTMAP06454 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTMAP06454 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTMAP06454 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTMAP06454 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTMAP06454 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PTMAP06454 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PTMAP06454 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTMAP06454 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTMAP06454 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PTMAP06454 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTMAP06454 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTMAP06454 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PTMAP06454 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PTMAP06454 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTMAP06454 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTMAP06454 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTMAP06454 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTMAP06454 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTMAP06454 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTMAP06454 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTMAP06454 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTMAP06454 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTMAP06454 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTMAP06454 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTMAP06454 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTMAP06454 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTMAP06454 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTMAP06454 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTMAP06454 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTMAP06454 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTMAP06454 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTMAP06454 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTMAP06454 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTMAP06454 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTMAP06454 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTMAP06454 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTMAP06454 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTMAP06454 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTMAP06454 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PTMAP06454 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTMAP06454 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTMAP06454 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTMAP06454 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTMAP06454 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTMAP06454 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTMAP06454 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTMAP06454 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PTMAP06454 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTMAP06454 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTMAP06454 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTMAP06454 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTMAP06454 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTMAP06454 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PTMAP06454 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTMAP06454 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTMAP06454 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTMAP06454 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTMAP06454 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTMAP06454 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PTMAP06454 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms