Protein–RNA interactions for Protein: P02654

APOC1, Apolipoprotein C-I, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC1P02654 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOC1P02654 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOC1P02654 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOC1P02654 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOC1P02654 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOC1P02654 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOC1P02654 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOC1P02654 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOC1P02654 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOC1P02654 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOC1P02654 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOC1P02654 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOC1P02654 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOC1P02654 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
APOC1P02654 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOC1P02654 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOC1P02654 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOC1P02654 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOC1P02654 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOC1P02654 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOC1P02654 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOC1P02654 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOC1P02654 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOC1P02654 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOC1P02654 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOC1P02654 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOC1P02654 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOC1P02654 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOC1P02654 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOC1P02654 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOC1P02654 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOC1P02654 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOC1P02654 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOC1P02654 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
APOC1P02654 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOC1P02654 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOC1P02654 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOC1P02654 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
APOC1P02654 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
APOC1P02654 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
APOC1P02654 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOC1P02654 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOC1P02654 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOC1P02654 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOC1P02654 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOC1P02654 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOC1P02654 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOC1P02654 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOC1P02654 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOC1P02654 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOC1P02654 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOC1P02654 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOC1P02654 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOC1P02654 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOC1P02654 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOC1P02654 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
APOC1P02654 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOC1P02654 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOC1P02654 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOC1P02654 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOC1P02654 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOC1P02654 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOC1P02654 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOC1P02654 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOC1P02654 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOC1P02654 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOC1P02654 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOC1P02654 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
APOC1P02654 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOC1P02654 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOC1P02654 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOC1P02654 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
APOC1P02654 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOC1P02654 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOC1P02654 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOC1P02654 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOC1P02654 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOC1P02654 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOC1P02654 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOC1P02654 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOC1P02654 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOC1P02654 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOC1P02654 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOC1P02654 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOC1P02654 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOC1P02654 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOC1P02654 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOC1P02654 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOC1P02654 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOC1P02654 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOC1P02654 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOC1P02654 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOC1P02654 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOC1P02654 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOC1P02654 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
APOC1P02654 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOC1P02654 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOC1P02654 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOC1P02654 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOC1P02654 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms