Protein–RNA interactions for Protein: P01891

HLA-A, HLA class I histocompatibility antigen, A-68 alpha chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-AP01891 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-AP01891 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-AP01891 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-AP01891 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-AP01891 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-AP01891 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-AP01891 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-AP01891 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-AP01891 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-AP01891 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-AP01891 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-AP01891 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-AP01891 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-AP01891 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-AP01891 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-AP01891 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-AP01891 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-AP01891 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-AP01891 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HLA-AP01891 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-AP01891 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-AP01891 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-AP01891 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-AP01891 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-AP01891 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-AP01891 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-AP01891 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-AP01891 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-AP01891 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-AP01891 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-AP01891 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-AP01891 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-AP01891 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-AP01891 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-AP01891 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-AP01891 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-AP01891 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-AP01891 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-AP01891 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-AP01891 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HLA-AP01891 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-AP01891 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-AP01891 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-AP01891 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-AP01891 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-AP01891 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-AP01891 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-AP01891 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-AP01891 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-AP01891 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-AP01891 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-AP01891 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-AP01891 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-AP01891 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-AP01891 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-AP01891 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-AP01891 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-AP01891 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-AP01891 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-AP01891 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-AP01891 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-AP01891 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HLA-AP01891 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-AP01891 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-AP01891 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-AP01891 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-AP01891 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-AP01891 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-AP01891 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-AP01891 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-AP01891 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-AP01891 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-AP01891 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-AP01891 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-AP01891 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-AP01891 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-AP01891 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-AP01891 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-AP01891 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-AP01891 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-AP01891 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-AP01891 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-AP01891 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-AP01891 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-AP01891 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-AP01891 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-AP01891 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HLA-AP01891 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-AP01891 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-AP01891 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-AP01891 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-AP01891 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-AP01891 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-AP01891 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-AP01891 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-AP01891 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-AP01891 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-AP01891 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-AP01891 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HLA-AP01891 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms