Protein–RNA interactions for Protein: P01599

IGKV1-17, Immunoglobulin kappa variable 1-17, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-17P01599 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IGKV1-17P01599 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IGKV1-17P01599 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IGKV1-17P01599 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IGKV1-17P01599 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IGKV1-17P01599 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
IGKV1-17P01599 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IGKV1-17P01599 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IGKV1-17P01599 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IGKV1-17P01599 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IGKV1-17P01599 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IGKV1-17P01599 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IGKV1-17P01599 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IGKV1-17P01599 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IGKV1-17P01599 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IGKV1-17P01599 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
IGKV1-17P01599 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
IGKV1-17P01599 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
IGKV1-17P01599 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
IGKV1-17P01599 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IGKV1-17P01599 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms