Protein–RNA interactions for Protein: O96008

TOMM40, Mitochondrial import receptor subunit TOM40 homolog, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOMM40O96008 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TOMM40O96008 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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