Protein–RNA interactions for Protein: O95248

SBF1, Myotubularin-related protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBF1O95248 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SBF1O95248 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SBF1O95248 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SBF1O95248 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SBF1O95248 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SBF1O95248 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SBF1O95248 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SBF1O95248 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SBF1O95248 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SBF1O95248 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SBF1O95248 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SBF1O95248 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SBF1O95248 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SBF1O95248 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SBF1O95248 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SBF1O95248 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SBF1O95248 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SBF1O95248 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SBF1O95248 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SBF1O95248 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SBF1O95248 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SBF1O95248 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SBF1O95248 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SBF1O95248 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SBF1O95248 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SBF1O95248 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SBF1O95248 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SBF1O95248 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SBF1O95248 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SBF1O95248 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SBF1O95248 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SBF1O95248 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SBF1O95248 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SBF1O95248 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SBF1O95248 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SBF1O95248 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SBF1O95248 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SBF1O95248 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SBF1O95248 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SBF1O95248 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SBF1O95248 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SBF1O95248 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SBF1O95248 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SBF1O95248 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SBF1O95248 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SBF1O95248 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SBF1O95248 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SBF1O95248 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SBF1O95248 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SBF1O95248 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SBF1O95248 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SBF1O95248 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SBF1O95248 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SBF1O95248 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SBF1O95248 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SBF1O95248 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SBF1O95248 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SBF1O95248 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SBF1O95248 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SBF1O95248 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SBF1O95248 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SBF1O95248 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SBF1O95248 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SBF1O95248 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SBF1O95248 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SBF1O95248 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SBF1O95248 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SBF1O95248 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SBF1O95248 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SBF1O95248 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SBF1O95248 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SBF1O95248 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SBF1O95248 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SBF1O95248 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SBF1O95248 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SBF1O95248 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SBF1O95248 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SBF1O95248 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SBF1O95248 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SBF1O95248 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SBF1O95248 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SBF1O95248 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SBF1O95248 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SBF1O95248 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SBF1O95248 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SBF1O95248 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SBF1O95248 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SBF1O95248 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SBF1O95248 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SBF1O95248 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SBF1O95248 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SBF1O95248 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SBF1O95248 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SBF1O95248 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SBF1O95248 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SBF1O95248 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SBF1O95248 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SBF1O95248 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SBF1O95248 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SBF1O95248 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms