Protein–RNA interactions for Protein: O94983

CAMTA2, Calmodulin-binding transcription activator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMTA2O94983 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CAMTA2O94983 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAMTA2O94983 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAMTA2O94983 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAMTA2O94983 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
CAMTA2O94983 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CAMTA2O94983 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CAMTA2O94983 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CAMTA2O94983 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CAMTA2O94983 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CAMTA2O94983 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CAMTA2O94983 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CAMTA2O94983 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CAMTA2O94983 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CAMTA2O94983 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CAMTA2O94983 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CAMTA2O94983 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CAMTA2O94983 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CAMTA2O94983 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAMTA2O94983 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAMTA2O94983 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAMTA2O94983 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAMTA2O94983 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAMTA2O94983 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAMTA2O94983 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAMTA2O94983 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAMTA2O94983 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAMTA2O94983 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAMTA2O94983 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CAMTA2O94983 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAMTA2O94983 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAMTA2O94983 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAMTA2O94983 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAMTA2O94983 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAMTA2O94983 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAMTA2O94983 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAMTA2O94983 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAMTA2O94983 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAMTA2O94983 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAMTA2O94983 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAMTA2O94983 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAMTA2O94983 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAMTA2O94983 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAMTA2O94983 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAMTA2O94983 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAMTA2O94983 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CAMTA2O94983 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAMTA2O94983 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAMTA2O94983 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAMTA2O94983 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CAMTA2O94983 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CAMTA2O94983 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CAMTA2O94983 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CAMTA2O94983 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CAMTA2O94983 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CAMTA2O94983 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CAMTA2O94983 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CAMTA2O94983 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CAMTA2O94983 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CAMTA2O94983 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CAMTA2O94983 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CAMTA2O94983 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CAMTA2O94983 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CAMTA2O94983 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CAMTA2O94983 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CAMTA2O94983 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CAMTA2O94983 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CAMTA2O94983 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CAMTA2O94983 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CAMTA2O94983 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CAMTA2O94983 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CAMTA2O94983 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CAMTA2O94983 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CAMTA2O94983 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CAMTA2O94983 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CAMTA2O94983 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CAMTA2O94983 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CAMTA2O94983 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CAMTA2O94983 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAMTA2O94983 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAMTA2O94983 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAMTA2O94983 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAMTA2O94983 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAMTA2O94983 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAMTA2O94983 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAMTA2O94983 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAMTA2O94983 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAMTA2O94983 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAMTA2O94983 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAMTA2O94983 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAMTA2O94983 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CAMTA2O94983 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CAMTA2O94983 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAMTA2O94983 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAMTA2O94983 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAMTA2O94983 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAMTA2O94983 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAMTA2O94983 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CAMTA2O94983 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CAMTA2O94983 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms