Protein–RNA interactions for Protein: O75936

BBOX1, Gamma-butyrobetaine dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOX1O75936 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
BBOX1O75936 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BBOX1O75936 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BBOX1O75936 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BBOX1O75936 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BBOX1O75936 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BBOX1O75936 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BBOX1O75936 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BBOX1O75936 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BBOX1O75936 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BBOX1O75936 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BBOX1O75936 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BBOX1O75936 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BBOX1O75936 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BBOX1O75936 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BBOX1O75936 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BBOX1O75936 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BBOX1O75936 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BBOX1O75936 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BBOX1O75936 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BBOX1O75936 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BBOX1O75936 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BBOX1O75936 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BBOX1O75936 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BBOX1O75936 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BBOX1O75936 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BBOX1O75936 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BBOX1O75936 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BBOX1O75936 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BBOX1O75936 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BBOX1O75936 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BBOX1O75936 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BBOX1O75936 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BBOX1O75936 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BBOX1O75936 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BBOX1O75936 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BBOX1O75936 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BBOX1O75936 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BBOX1O75936 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BBOX1O75936 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BBOX1O75936 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BBOX1O75936 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BBOX1O75936 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BBOX1O75936 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BBOX1O75936 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BBOX1O75936 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BBOX1O75936 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BBOX1O75936 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BBOX1O75936 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BBOX1O75936 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BBOX1O75936 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BBOX1O75936 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BBOX1O75936 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BBOX1O75936 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BBOX1O75936 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BBOX1O75936 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BBOX1O75936 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BBOX1O75936 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BBOX1O75936 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BBOX1O75936 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BBOX1O75936 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BBOX1O75936 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BBOX1O75936 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BBOX1O75936 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BBOX1O75936 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
BBOX1O75936 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
BBOX1O75936 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BBOX1O75936 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
BBOX1O75936 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BBOX1O75936 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BBOX1O75936 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BBOX1O75936 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BBOX1O75936 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BBOX1O75936 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BBOX1O75936 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BBOX1O75936 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
BBOX1O75936 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BBOX1O75936 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BBOX1O75936 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BBOX1O75936 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
BBOX1O75936 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BBOX1O75936 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BBOX1O75936 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BBOX1O75936 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BBOX1O75936 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BBOX1O75936 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BBOX1O75936 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
BBOX1O75936 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BBOX1O75936 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BBOX1O75936 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BBOX1O75936 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BBOX1O75936 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BBOX1O75936 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BBOX1O75936 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
BBOX1O75936 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
BBOX1O75936 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BBOX1O75936 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BBOX1O75936 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BBOX1O75936 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BBOX1O75936 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms