Protein–RNA interactions for Protein: O75683

SURF6, Surfeit locus protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF6O75683 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SURF6O75683 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SURF6O75683 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SURF6O75683 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SURF6O75683 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SURF6O75683 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SURF6O75683 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SURF6O75683 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SURF6O75683 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SURF6O75683 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SURF6O75683 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SURF6O75683 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SURF6O75683 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SURF6O75683 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SURF6O75683 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SURF6O75683 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SURF6O75683 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SURF6O75683 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SURF6O75683 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SURF6O75683 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SURF6O75683 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SURF6O75683 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SURF6O75683 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SURF6O75683 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SURF6O75683 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SURF6O75683 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SURF6O75683 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SURF6O75683 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SURF6O75683 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SURF6O75683 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SURF6O75683 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SURF6O75683 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SURF6O75683 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SURF6O75683 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SURF6O75683 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SURF6O75683 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SURF6O75683 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SURF6O75683 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SURF6O75683 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SURF6O75683 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SURF6O75683 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SURF6O75683 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SURF6O75683 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SURF6O75683 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SURF6O75683 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SURF6O75683 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SURF6O75683 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SURF6O75683 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SURF6O75683 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SURF6O75683 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SURF6O75683 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SURF6O75683 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SURF6O75683 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SURF6O75683 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SURF6O75683 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SURF6O75683 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SURF6O75683 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SURF6O75683 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SURF6O75683 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SURF6O75683 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SURF6O75683 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SURF6O75683 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SURF6O75683 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SURF6O75683 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SURF6O75683 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SURF6O75683 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SURF6O75683 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SURF6O75683 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SURF6O75683 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SURF6O75683 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SURF6O75683 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SURF6O75683 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SURF6O75683 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SURF6O75683 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SURF6O75683 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SURF6O75683 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SURF6O75683 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SURF6O75683 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SURF6O75683 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SURF6O75683 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SURF6O75683 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SURF6O75683 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SURF6O75683 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SURF6O75683 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SURF6O75683 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SURF6O75683 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SURF6O75683 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SURF6O75683 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SURF6O75683 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SURF6O75683 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SURF6O75683 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SURF6O75683 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SURF6O75683 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SURF6O75683 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SURF6O75683 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SURF6O75683 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SURF6O75683 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SURF6O75683 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SURF6O75683 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SURF6O75683 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms