Protein–RNA interactions for Protein: O60504

SORBS3, Vinexin, humanhuman

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORBS3O60504 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SORBS3O60504 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SORBS3O60504 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SORBS3O60504 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SORBS3O60504 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SORBS3O60504 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SORBS3O60504 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SORBS3O60504 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SORBS3O60504 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SORBS3O60504 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SORBS3O60504 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SORBS3O60504 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SORBS3O60504 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SORBS3O60504 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SORBS3O60504 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SORBS3O60504 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SORBS3O60504 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SORBS3O60504 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SORBS3O60504 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SORBS3O60504 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SORBS3O60504 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SORBS3O60504 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SORBS3O60504 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SORBS3O60504 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SORBS3O60504 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SORBS3O60504 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SORBS3O60504 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SORBS3O60504 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SORBS3O60504 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SORBS3O60504 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SORBS3O60504 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SORBS3O60504 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SORBS3O60504 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SORBS3O60504 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SORBS3O60504 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SORBS3O60504 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SORBS3O60504 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SORBS3O60504 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SORBS3O60504 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SORBS3O60504 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SORBS3O60504 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SORBS3O60504 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SORBS3O60504 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SORBS3O60504 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SORBS3O60504 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SORBS3O60504 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SORBS3O60504 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SORBS3O60504 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SORBS3O60504 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SORBS3O60504 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SORBS3O60504 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SORBS3O60504 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SORBS3O60504 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SORBS3O60504 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SORBS3O60504 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SORBS3O60504 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SORBS3O60504 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SORBS3O60504 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SORBS3O60504 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SORBS3O60504 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SORBS3O60504 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SORBS3O60504 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SORBS3O60504 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SORBS3O60504 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SORBS3O60504 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SORBS3O60504 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SORBS3O60504 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SORBS3O60504 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SORBS3O60504 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SORBS3O60504 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SORBS3O60504 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SORBS3O60504 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SORBS3O60504 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SORBS3O60504 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SORBS3O60504 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SORBS3O60504 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SORBS3O60504 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SORBS3O60504 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SORBS3O60504 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SORBS3O60504 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SORBS3O60504 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SORBS3O60504 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SORBS3O60504 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SORBS3O60504 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SORBS3O60504 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SORBS3O60504 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SORBS3O60504 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SORBS3O60504 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SORBS3O60504 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SORBS3O60504 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SORBS3O60504 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SORBS3O60504 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SORBS3O60504 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SORBS3O60504 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SORBS3O60504 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SORBS3O60504 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SORBS3O60504 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SORBS3O60504 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SORBS3O60504 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SORBS3O60504 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms