Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAK2O60296 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAK2O60296 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAK2O60296 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAK2O60296 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAK2O60296 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAK2O60296 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAK2O60296 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAK2O60296 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAK2O60296 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAK2O60296 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAK2O60296 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAK2O60296 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAK2O60296 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAK2O60296 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAK2O60296 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAK2O60296 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAK2O60296 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAK2O60296 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAK2O60296 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAK2O60296 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAK2O60296 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAK2O60296 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAK2O60296 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAK2O60296 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAK2O60296 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAK2O60296 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAK2O60296 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAK2O60296 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAK2O60296 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAK2O60296 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRAK2O60296 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRAK2O60296 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRAK2O60296 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRAK2O60296 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAK2O60296 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAK2O60296 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAK2O60296 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAK2O60296 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAK2O60296 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAK2O60296 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAK2O60296 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAK2O60296 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAK2O60296 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAK2O60296 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAK2O60296 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAK2O60296 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAK2O60296 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAK2O60296 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAK2O60296 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAK2O60296 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAK2O60296 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAK2O60296 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAK2O60296 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAK2O60296 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAK2O60296 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAK2O60296 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAK2O60296 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAK2O60296 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAK2O60296 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAK2O60296 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAK2O60296 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAK2O60296 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAK2O60296 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAK2O60296 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAK2O60296 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAK2O60296 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAK2O60296 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAK2O60296 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAK2O60296 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAK2O60296 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAK2O60296 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAK2O60296 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAK2O60296 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAK2O60296 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAK2O60296 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAK2O60296 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAK2O60296 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAK2O60296 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAK2O60296 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAK2O60296 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAK2O60296 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAK2O60296 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAK2O60296 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAK2O60296 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAK2O60296 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAK2O60296 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAK2O60296 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAK2O60296 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAK2O60296 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAK2O60296 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAK2O60296 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAK2O60296 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAK2O60296 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAK2O60296 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAK2O60296 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAK2O60296 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAK2O60296 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAK2O60296 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAK2O60296 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms