Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6DO43924 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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