Protein–RNA interactions for Protein: O43772

SLC25A20, Mitochondrial carnitine/acylcarnitine carrier protein, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A20O43772 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SLC25A20O43772 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SLC25A20O43772 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SLC25A20O43772 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SLC25A20O43772 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SLC25A20O43772 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SLC25A20O43772 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SLC25A20O43772 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SLC25A20O43772 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SLC25A20O43772 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SLC25A20O43772 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SLC25A20O43772 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SLC25A20O43772 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SLC25A20O43772 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SLC25A20O43772 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SLC25A20O43772 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SLC25A20O43772 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SLC25A20O43772 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLC25A20O43772 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLC25A20O43772 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLC25A20O43772 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLC25A20O43772 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLC25A20O43772 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLC25A20O43772 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLC25A20O43772 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLC25A20O43772 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SLC25A20O43772 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLC25A20O43772 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLC25A20O43772 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLC25A20O43772 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLC25A20O43772 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLC25A20O43772 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLC25A20O43772 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLC25A20O43772 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLC25A20O43772 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLC25A20O43772 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLC25A20O43772 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLC25A20O43772 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SLC25A20O43772 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLC25A20O43772 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLC25A20O43772 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLC25A20O43772 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLC25A20O43772 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLC25A20O43772 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLC25A20O43772 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLC25A20O43772 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLC25A20O43772 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLC25A20O43772 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLC25A20O43772 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLC25A20O43772 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLC25A20O43772 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLC25A20O43772 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLC25A20O43772 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLC25A20O43772 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLC25A20O43772 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SLC25A20O43772 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SLC25A20O43772 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLC25A20O43772 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLC25A20O43772 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLC25A20O43772 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLC25A20O43772 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLC25A20O43772 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLC25A20O43772 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLC25A20O43772 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLC25A20O43772 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLC25A20O43772 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SLC25A20O43772 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SLC25A20O43772 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SLC25A20O43772 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SLC25A20O43772 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SLC25A20O43772 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SLC25A20O43772 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SLC25A20O43772 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SLC25A20O43772 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SLC25A20O43772 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SLC25A20O43772 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SLC25A20O43772 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SLC25A20O43772 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SLC25A20O43772 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SLC25A20O43772 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SLC25A20O43772 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SLC25A20O43772 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SLC25A20O43772 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SLC25A20O43772 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SLC25A20O43772 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SLC25A20O43772 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SLC25A20O43772 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SLC25A20O43772 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SLC25A20O43772 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SLC25A20O43772 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SLC25A20O43772 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SLC25A20O43772 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SLC25A20O43772 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SLC25A20O43772 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SLC25A20O43772 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SLC25A20O43772 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SLC25A20O43772 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SLC25A20O43772 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SLC25A20O43772 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SLC25A20O43772 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms