Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKAB2O43741 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKAB2O43741 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKAB2O43741 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKAB2O43741 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKAB2O43741 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKAB2O43741 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKAB2O43741 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKAB2O43741 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKAB2O43741 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKAB2O43741 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKAB2O43741 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKAB2O43741 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKAB2O43741 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKAB2O43741 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRKAB2O43741 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRKAB2O43741 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRKAB2O43741 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRKAB2O43741 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRKAB2O43741 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRKAB2O43741 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRKAB2O43741 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRKAB2O43741 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRKAB2O43741 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRKAB2O43741 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRKAB2O43741 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRKAB2O43741 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PRKAB2O43741 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PRKAB2O43741 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PRKAB2O43741 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKAB2O43741 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKAB2O43741 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKAB2O43741 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKAB2O43741 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKAB2O43741 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKAB2O43741 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKAB2O43741 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKAB2O43741 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKAB2O43741 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKAB2O43741 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKAB2O43741 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKAB2O43741 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKAB2O43741 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKAB2O43741 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKAB2O43741 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKAB2O43741 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKAB2O43741 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKAB2O43741 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKAB2O43741 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKAB2O43741 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKAB2O43741 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKAB2O43741 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKAB2O43741 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKAB2O43741 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKAB2O43741 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKAB2O43741 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKAB2O43741 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKAB2O43741 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKAB2O43741 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKAB2O43741 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKAB2O43741 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKAB2O43741 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKAB2O43741 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKAB2O43741 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKAB2O43741 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKAB2O43741 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKAB2O43741 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKAB2O43741 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKAB2O43741 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKAB2O43741 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKAB2O43741 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKAB2O43741 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKAB2O43741 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKAB2O43741 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKAB2O43741 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKAB2O43741 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKAB2O43741 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKAB2O43741 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKAB2O43741 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKAB2O43741 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKAB2O43741 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKAB2O43741 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKAB2O43741 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKAB2O43741 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKAB2O43741 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKAB2O43741 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKAB2O43741 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKAB2O43741 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKAB2O43741 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKAB2O43741 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKAB2O43741 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKAB2O43741 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKAB2O43741 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKAB2O43741 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKAB2O43741 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKAB2O43741 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKAB2O43741 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKAB2O43741 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKAB2O43741 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKAB2O43741 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms