Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTPRTO14522 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTPRTO14522 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTPRTO14522 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTPRTO14522 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTPRTO14522 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTPRTO14522 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTPRTO14522 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTPRTO14522 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTPRTO14522 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTPRTO14522 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTPRTO14522 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTPRTO14522 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTPRTO14522 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
PTPRTO14522 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTPRTO14522 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTPRTO14522 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTPRTO14522 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PTPRTO14522 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PTPRTO14522 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PTPRTO14522 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PTPRTO14522 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PTPRTO14522 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PTPRTO14522 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PTPRTO14522 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PTPRTO14522 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PTPRTO14522 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PTPRTO14522 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PTPRTO14522 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PTPRTO14522 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PTPRTO14522 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PTPRTO14522 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PTPRTO14522 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PTPRTO14522 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PTPRTO14522 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PTPRTO14522 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PTPRTO14522 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PTPRTO14522 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PTPRTO14522 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PTPRTO14522 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PTPRTO14522 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PTPRTO14522 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PTPRTO14522 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
PTPRTO14522 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PTPRTO14522 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PTPRTO14522 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
PTPRTO14522 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
PTPRTO14522 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
PTPRTO14522 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
PTPRTO14522 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.4
PTPRTO14522 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
PTPRTO14522 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PTPRTO14522 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PTPRTO14522 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PTPRTO14522 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
PTPRTO14522 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PTPRTO14522 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PTPRTO14522 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PTPRTO14522 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PTPRTO14522 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
PTPRTO14522 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PTPRTO14522 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PTPRTO14522 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PTPRTO14522 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PTPRTO14522 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC30■■■□□ 2.39
PTPRTO14522 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTPRTO14522 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTPRTO14522 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
PTPRTO14522 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTPRTO14522 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTPRTO14522 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTPRTO14522 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTPRTO14522 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTPRTO14522 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTPRTO14522 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTPRTO14522 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTPRTO14522 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PTPRTO14522 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PTPRTO14522 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PTPRTO14522 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PTPRTO14522 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PTPRTO14522 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PTPRTO14522 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PTPRTO14522 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PTPRTO14522 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PTPRTO14522 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PTPRTO14522 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PTPRTO14522 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PTPRTO14522 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
PTPRTO14522 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PTPRTO14522 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
PTPRTO14522 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
PTPRTO14522 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PTPRTO14522 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PTPRTO14522 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PTPRTO14522 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PTPRTO14522 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PTPRTO14522 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PTPRTO14522 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PTPRTO14522 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
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