Protein–RNA interactions for Protein: O00628

PEX7, Peroxisomal targeting signal 2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX7O00628 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX7O00628 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX7O00628 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX7O00628 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX7O00628 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX7O00628 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX7O00628 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX7O00628 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX7O00628 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX7O00628 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX7O00628 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX7O00628 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX7O00628 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX7O00628 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX7O00628 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX7O00628 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX7O00628 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX7O00628 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX7O00628 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX7O00628 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX7O00628 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX7O00628 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX7O00628 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX7O00628 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX7O00628 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX7O00628 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX7O00628 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX7O00628 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX7O00628 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX7O00628 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX7O00628 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX7O00628 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX7O00628 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX7O00628 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX7O00628 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX7O00628 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX7O00628 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX7O00628 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX7O00628 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX7O00628 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX7O00628 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX7O00628 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX7O00628 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX7O00628 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX7O00628 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX7O00628 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PEX7O00628 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PEX7O00628 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PEX7O00628 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PEX7O00628 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PEX7O00628 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PEX7O00628 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PEX7O00628 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PEX7O00628 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
PEX7O00628 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX7O00628 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX7O00628 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX7O00628 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX7O00628 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX7O00628 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX7O00628 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX7O00628 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX7O00628 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX7O00628 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX7O00628 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX7O00628 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX7O00628 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX7O00628 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX7O00628 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX7O00628 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX7O00628 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX7O00628 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX7O00628 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX7O00628 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX7O00628 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX7O00628 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX7O00628 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX7O00628 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX7O00628 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX7O00628 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX7O00628 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX7O00628 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX7O00628 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX7O00628 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX7O00628 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX7O00628 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX7O00628 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX7O00628 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX7O00628 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX7O00628 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX7O00628 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX7O00628 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX7O00628 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX7O00628 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX7O00628 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX7O00628 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX7O00628 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX7O00628 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX7O00628 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX7O00628 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms