Protein–RNA interactions for Protein: H7C1W4

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1W4 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
H7C1W4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
H7C1W4 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
H7C1W4 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
H7C1W4 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
H7C1W4 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
H7C1W4 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
H7C1W4 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
H7C1W4 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
H7C1W4 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
H7C1W4 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
H7C1W4 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
H7C1W4 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
H7C1W4 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
H7C1W4 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
H7C1W4 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
H7C1W4 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
H7C1W4 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
H7C1W4 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
H7C1W4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
H7C1W4 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
H7C1W4 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
H7C1W4 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
H7C1W4 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
H7C1W4 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
H7C1W4 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
H7C1W4 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
H7C1W4 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
H7C1W4 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
H7C1W4 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
H7C1W4 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
H7C1W4 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
H7C1W4 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
H7C1W4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
H7C1W4 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
H7C1W4 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
H7C1W4 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
H7C1W4 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
H7C1W4 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
H7C1W4 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
H7C1W4 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
H7C1W4 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
H7C1W4 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
H7C1W4 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
H7C1W4 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
H7C1W4 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
H7C1W4 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
H7C1W4 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
H7C1W4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
H7C1W4 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
H7C1W4 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
H7C1W4 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
H7C1W4 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
H7C1W4 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
H7C1W4 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
H7C1W4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
H7C1W4 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
H7C1W4 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
H7C1W4 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
H7C1W4 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
H7C1W4 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
H7C1W4 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
H7C1W4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
H7C1W4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
H7C1W4 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
H7C1W4 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
H7C1W4 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
H7C1W4 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
H7C1W4 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
H7C1W4 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
H7C1W4 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
H7C1W4 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
H7C1W4 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
H7C1W4 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
H7C1W4 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
H7C1W4 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
H7C1W4 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
H7C1W4 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
H7C1W4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
H7C1W4 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
H7C1W4 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
H7C1W4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
H7C1W4 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
H7C1W4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
H7C1W4 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
H7C1W4 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
H7C1W4 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
H7C1W4 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
H7C1W4 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
H7C1W4 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
H7C1W4 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
H7C1W4 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
H7C1W4 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
H7C1W4 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
H7C1W4 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
H7C1W4 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
H7C1W4 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
H7C1W4 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
H7C1W4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
H7C1W4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms