Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERVV-1B6SEH8 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERVV-1B6SEH8 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERVV-1B6SEH8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ERVV-1B6SEH8 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ERVV-1B6SEH8 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ERVV-1B6SEH8 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ERVV-1B6SEH8 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ERVV-1B6SEH8 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ERVV-1B6SEH8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ERVV-1B6SEH8 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ERVV-1B6SEH8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ERVV-1B6SEH8 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ERVV-1B6SEH8 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ERVV-1B6SEH8 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ERVV-1B6SEH8 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ERVV-1B6SEH8 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ERVV-1B6SEH8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ERVV-1B6SEH8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ERVV-1B6SEH8 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ERVV-1B6SEH8 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ERVV-1B6SEH8 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ERVV-1B6SEH8 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ERVV-1B6SEH8 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ERVV-1B6SEH8 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ERVV-1B6SEH8 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
ERVV-1B6SEH8 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ERVV-1B6SEH8 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ERVV-1B6SEH8 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ERVV-1B6SEH8 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ERVV-1B6SEH8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ERVV-1B6SEH8 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ERVV-1B6SEH8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ERVV-1B6SEH8 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ERVV-1B6SEH8 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ERVV-1B6SEH8 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ERVV-1B6SEH8 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ERVV-1B6SEH8 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ERVV-1B6SEH8 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ERVV-1B6SEH8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ERVV-1B6SEH8 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ERVV-1B6SEH8 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ERVV-1B6SEH8 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ERVV-1B6SEH8 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ERVV-1B6SEH8 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ERVV-1B6SEH8 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ERVV-1B6SEH8 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ERVV-1B6SEH8 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ERVV-1B6SEH8 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ERVV-1B6SEH8 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ERVV-1B6SEH8 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ERVV-1B6SEH8 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ERVV-1B6SEH8 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ERVV-1B6SEH8 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ERVV-1B6SEH8 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ERVV-1B6SEH8 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ERVV-1B6SEH8 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ERVV-1B6SEH8 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ERVV-1B6SEH8 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ERVV-1B6SEH8 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ERVV-1B6SEH8 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ERVV-1B6SEH8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ERVV-1B6SEH8 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ERVV-1B6SEH8 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ERVV-1B6SEH8 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ERVV-1B6SEH8 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ERVV-1B6SEH8 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ERVV-1B6SEH8 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ERVV-1B6SEH8 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ERVV-1B6SEH8 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ERVV-1B6SEH8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ERVV-1B6SEH8 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ERVV-1B6SEH8 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ERVV-1B6SEH8 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ERVV-1B6SEH8 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ERVV-1B6SEH8 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ERVV-1B6SEH8 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ERVV-1B6SEH8 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ERVV-1B6SEH8 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ERVV-1B6SEH8 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ERVV-1B6SEH8 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ERVV-1B6SEH8 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ERVV-1B6SEH8 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ERVV-1B6SEH8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ERVV-1B6SEH8 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ERVV-1B6SEH8 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ERVV-1B6SEH8 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ERVV-1B6SEH8 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ERVV-1B6SEH8 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ERVV-1B6SEH8 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ERVV-1B6SEH8 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ERVV-1B6SEH8 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ERVV-1B6SEH8 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ERVV-1B6SEH8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ERVV-1B6SEH8 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ERVV-1B6SEH8 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ERVV-1B6SEH8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ERVV-1B6SEH8 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ERVV-1B6SEH8 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ERVV-1B6SEH8 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms