Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ27

NEURL1B, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL1BA8MQ27 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NEURL1BA8MQ27 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEURL1BA8MQ27 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEURL1BA8MQ27 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEURL1BA8MQ27 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEURL1BA8MQ27 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEURL1BA8MQ27 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEURL1BA8MQ27 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEURL1BA8MQ27 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEURL1BA8MQ27 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEURL1BA8MQ27 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEURL1BA8MQ27 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEURL1BA8MQ27 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEURL1BA8MQ27 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEURL1BA8MQ27 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEURL1BA8MQ27 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEURL1BA8MQ27 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEURL1BA8MQ27 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEURL1BA8MQ27 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEURL1BA8MQ27 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEURL1BA8MQ27 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
NEURL1BA8MQ27 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEURL1BA8MQ27 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEURL1BA8MQ27 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEURL1BA8MQ27 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEURL1BA8MQ27 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEURL1BA8MQ27 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEURL1BA8MQ27 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEURL1BA8MQ27 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEURL1BA8MQ27 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEURL1BA8MQ27 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEURL1BA8MQ27 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEURL1BA8MQ27 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEURL1BA8MQ27 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEURL1BA8MQ27 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEURL1BA8MQ27 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
NEURL1BA8MQ27 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEURL1BA8MQ27 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEURL1BA8MQ27 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEURL1BA8MQ27 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEURL1BA8MQ27 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEURL1BA8MQ27 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEURL1BA8MQ27 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEURL1BA8MQ27 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEURL1BA8MQ27 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEURL1BA8MQ27 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEURL1BA8MQ27 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEURL1BA8MQ27 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEURL1BA8MQ27 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEURL1BA8MQ27 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEURL1BA8MQ27 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEURL1BA8MQ27 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEURL1BA8MQ27 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NEURL1BA8MQ27 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEURL1BA8MQ27 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEURL1BA8MQ27 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEURL1BA8MQ27 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEURL1BA8MQ27 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NEURL1BA8MQ27 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NEURL1BA8MQ27 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NEURL1BA8MQ27 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NEURL1BA8MQ27 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NEURL1BA8MQ27 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NEURL1BA8MQ27 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NEURL1BA8MQ27 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NEURL1BA8MQ27 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NEURL1BA8MQ27 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NEURL1BA8MQ27 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NEURL1BA8MQ27 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NEURL1BA8MQ27 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NEURL1BA8MQ27 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NEURL1BA8MQ27 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NEURL1BA8MQ27 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NEURL1BA8MQ27 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NEURL1BA8MQ27 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NEURL1BA8MQ27 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NEURL1BA8MQ27 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NEURL1BA8MQ27 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NEURL1BA8MQ27 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NEURL1BA8MQ27 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NEURL1BA8MQ27 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NEURL1BA8MQ27 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
NEURL1BA8MQ27 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NEURL1BA8MQ27 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NEURL1BA8MQ27 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NEURL1BA8MQ27 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NEURL1BA8MQ27 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NEURL1BA8MQ27 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NEURL1BA8MQ27 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NEURL1BA8MQ27 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NEURL1BA8MQ27 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NEURL1BA8MQ27 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NEURL1BA8MQ27 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NEURL1BA8MQ27 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NEURL1BA8MQ27 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NEURL1BA8MQ27 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NEURL1BA8MQ27 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NEURL1BA8MQ27 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NEURL1BA8MQ27 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NEURL1BA8MQ27 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms