Protein–RNA interactions for Protein: A6NMK8

FAM196B, Protein FAM196B, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM196BA6NMK8 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM196BA6NMK8 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM196BA6NMK8 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM196BA6NMK8 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM196BA6NMK8 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM196BA6NMK8 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM196BA6NMK8 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM196BA6NMK8 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM196BA6NMK8 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM196BA6NMK8 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM196BA6NMK8 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM196BA6NMK8 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM196BA6NMK8 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM196BA6NMK8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM196BA6NMK8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM196BA6NMK8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM196BA6NMK8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM196BA6NMK8 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM196BA6NMK8 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM196BA6NMK8 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM196BA6NMK8 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM196BA6NMK8 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM196BA6NMK8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM196BA6NMK8 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM196BA6NMK8 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM196BA6NMK8 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM196BA6NMK8 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM196BA6NMK8 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM196BA6NMK8 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM196BA6NMK8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM196BA6NMK8 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM196BA6NMK8 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM196BA6NMK8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
FAM196BA6NMK8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
FAM196BA6NMK8 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
FAM196BA6NMK8 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
FAM196BA6NMK8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
FAM196BA6NMK8 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
FAM196BA6NMK8 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM196BA6NMK8 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM196BA6NMK8 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM196BA6NMK8 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM196BA6NMK8 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM196BA6NMK8 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM196BA6NMK8 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM196BA6NMK8 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM196BA6NMK8 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM196BA6NMK8 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM196BA6NMK8 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM196BA6NMK8 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM196BA6NMK8 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM196BA6NMK8 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM196BA6NMK8 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM196BA6NMK8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM196BA6NMK8 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM196BA6NMK8 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM196BA6NMK8 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM196BA6NMK8 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM196BA6NMK8 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM196BA6NMK8 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM196BA6NMK8 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM196BA6NMK8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM196BA6NMK8 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM196BA6NMK8 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM196BA6NMK8 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM196BA6NMK8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM196BA6NMK8 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM196BA6NMK8 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM196BA6NMK8 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM196BA6NMK8 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM196BA6NMK8 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM196BA6NMK8 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM196BA6NMK8 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM196BA6NMK8 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM196BA6NMK8 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM196BA6NMK8 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM196BA6NMK8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM196BA6NMK8 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM196BA6NMK8 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM196BA6NMK8 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM196BA6NMK8 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM196BA6NMK8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM196BA6NMK8 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM196BA6NMK8 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM196BA6NMK8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM196BA6NMK8 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM196BA6NMK8 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM196BA6NMK8 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM196BA6NMK8 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM196BA6NMK8 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM196BA6NMK8 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM196BA6NMK8 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM196BA6NMK8 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM196BA6NMK8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM196BA6NMK8 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM196BA6NMK8 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM196BA6NMK8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM196BA6NMK8 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM196BA6NMK8 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM196BA6NMK8 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms