Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
RGPD3A6NKT7 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RGPD3A6NKT7 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RGPD3A6NKT7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RGPD3A6NKT7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RGPD3A6NKT7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RGPD3A6NKT7 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RGPD3A6NKT7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RGPD3A6NKT7 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RGPD3A6NKT7 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RGPD3A6NKT7 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RGPD3A6NKT7 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RGPD3A6NKT7 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RGPD3A6NKT7 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RGPD3A6NKT7 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
RGPD3A6NKT7 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RGPD3A6NKT7 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RGPD3A6NKT7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
RGPD3A6NKT7 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RGPD3A6NKT7 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RGPD3A6NKT7 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RGPD3A6NKT7 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RGPD3A6NKT7 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RGPD3A6NKT7 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RGPD3A6NKT7 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
RGPD3A6NKT7 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
RGPD3A6NKT7 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
RGPD3A6NKT7 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RGPD3A6NKT7 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RGPD3A6NKT7 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RGPD3A6NKT7 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RGPD3A6NKT7 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RGPD3A6NKT7 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RGPD3A6NKT7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RGPD3A6NKT7 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RGPD3A6NKT7 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RGPD3A6NKT7 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RGPD3A6NKT7 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RGPD3A6NKT7 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RGPD3A6NKT7 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RGPD3A6NKT7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RGPD3A6NKT7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RGPD3A6NKT7 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RGPD3A6NKT7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RGPD3A6NKT7 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RGPD3A6NKT7 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RGPD3A6NKT7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RGPD3A6NKT7 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RGPD3A6NKT7 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RGPD3A6NKT7 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RGPD3A6NKT7 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RGPD3A6NKT7 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RGPD3A6NKT7 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RGPD3A6NKT7 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RGPD3A6NKT7 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RGPD3A6NKT7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RGPD3A6NKT7 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RGPD3A6NKT7 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RGPD3A6NKT7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RGPD3A6NKT7 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
RGPD3A6NKT7 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RGPD3A6NKT7 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RGPD3A6NKT7 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RGPD3A6NKT7 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RGPD3A6NKT7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RGPD3A6NKT7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RGPD3A6NKT7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RGPD3A6NKT7 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RGPD3A6NKT7 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
RGPD3A6NKT7 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
RGPD3A6NKT7 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
RGPD3A6NKT7 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RGPD3A6NKT7 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
RGPD3A6NKT7 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
RGPD3A6NKT7 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RGPD3A6NKT7 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RGPD3A6NKT7 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RGPD3A6NKT7 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RGPD3A6NKT7 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RGPD3A6NKT7 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RGPD3A6NKT7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RGPD3A6NKT7 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RGPD3A6NKT7 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RGPD3A6NKT7 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RGPD3A6NKT7 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
RGPD3A6NKT7 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RGPD3A6NKT7 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
RGPD3A6NKT7 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RGPD3A6NKT7 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RGPD3A6NKT7 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RGPD3A6NKT7 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RGPD3A6NKT7 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RGPD3A6NKT7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RGPD3A6NKT7 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RGPD3A6NKT7 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RGPD3A6NKT7 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
RGPD3A6NKT7 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RGPD3A6NKT7 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
RGPD3A6NKT7 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RGPD3A6NKT7 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms