Protein–RNA interactions for Protein: A6NFD8

HELT, Hairy and enhancer of split-related protein HELT, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELTA6NFD8 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HELTA6NFD8 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HELTA6NFD8 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms