Protein–RNA interactions for Protein: A6NDN3

GOLGA6B, Golgin subfamily A member 6B, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6BA6NDN3 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GOLGA6BA6NDN3 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GOLGA6BA6NDN3 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GOLGA6BA6NDN3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GOLGA6BA6NDN3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GOLGA6BA6NDN3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GOLGA6BA6NDN3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GOLGA6BA6NDN3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GOLGA6BA6NDN3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GOLGA6BA6NDN3 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GOLGA6BA6NDN3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GOLGA6BA6NDN3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GOLGA6BA6NDN3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GOLGA6BA6NDN3 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GOLGA6BA6NDN3 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GOLGA6BA6NDN3 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GOLGA6BA6NDN3 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GOLGA6BA6NDN3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GOLGA6BA6NDN3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GOLGA6BA6NDN3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GOLGA6BA6NDN3 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GOLGA6BA6NDN3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GOLGA6BA6NDN3 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GOLGA6BA6NDN3 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GOLGA6BA6NDN3 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GOLGA6BA6NDN3 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GOLGA6BA6NDN3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GOLGA6BA6NDN3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GOLGA6BA6NDN3 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GOLGA6BA6NDN3 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GOLGA6BA6NDN3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GOLGA6BA6NDN3 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GOLGA6BA6NDN3 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GOLGA6BA6NDN3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GOLGA6BA6NDN3 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GOLGA6BA6NDN3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GOLGA6BA6NDN3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GOLGA6BA6NDN3 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GOLGA6BA6NDN3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GOLGA6BA6NDN3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GOLGA6BA6NDN3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GOLGA6BA6NDN3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GOLGA6BA6NDN3 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GOLGA6BA6NDN3 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GOLGA6BA6NDN3 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GOLGA6BA6NDN3 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
GOLGA6BA6NDN3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
GOLGA6BA6NDN3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GOLGA6BA6NDN3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GOLGA6BA6NDN3 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GOLGA6BA6NDN3 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GOLGA6BA6NDN3 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GOLGA6BA6NDN3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GOLGA6BA6NDN3 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GOLGA6BA6NDN3 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GOLGA6BA6NDN3 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GOLGA6BA6NDN3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GOLGA6BA6NDN3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GOLGA6BA6NDN3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GOLGA6BA6NDN3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GOLGA6BA6NDN3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GOLGA6BA6NDN3 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GOLGA6BA6NDN3 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GOLGA6BA6NDN3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GOLGA6BA6NDN3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GOLGA6BA6NDN3 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GOLGA6BA6NDN3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GOLGA6BA6NDN3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GOLGA6BA6NDN3 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GOLGA6BA6NDN3 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GOLGA6BA6NDN3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GOLGA6BA6NDN3 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GOLGA6BA6NDN3 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GOLGA6BA6NDN3 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GOLGA6BA6NDN3 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GOLGA6BA6NDN3 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GOLGA6BA6NDN3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GOLGA6BA6NDN3 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GOLGA6BA6NDN3 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GOLGA6BA6NDN3 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GOLGA6BA6NDN3 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GOLGA6BA6NDN3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GOLGA6BA6NDN3 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GOLGA6BA6NDN3 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GOLGA6BA6NDN3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GOLGA6BA6NDN3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA6BA6NDN3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA6BA6NDN3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA6BA6NDN3 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA6BA6NDN3 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA6BA6NDN3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA6BA6NDN3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA6BA6NDN3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA6BA6NDN3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA6BA6NDN3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA6BA6NDN3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA6BA6NDN3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA6BA6NDN3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA6BA6NDN3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA6BA6NDN3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms