Protein–RNA interactions for Protein: A6NDK9

GOLGA6C, Golgin subfamily A member 6C, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6CA6NDK9 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms