Protein–RNA interactions for Protein: A6NCW7

USP17L4, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L4A6NCW7 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP17L4A6NCW7 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP17L4A6NCW7 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP17L4A6NCW7 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP17L4A6NCW7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP17L4A6NCW7 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP17L4A6NCW7 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP17L4A6NCW7 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP17L4A6NCW7 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
USP17L4A6NCW7 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP17L4A6NCW7 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP17L4A6NCW7 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP17L4A6NCW7 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
USP17L4A6NCW7 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP17L4A6NCW7 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP17L4A6NCW7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP17L4A6NCW7 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP17L4A6NCW7 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP17L4A6NCW7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP17L4A6NCW7 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP17L4A6NCW7 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP17L4A6NCW7 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP17L4A6NCW7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP17L4A6NCW7 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP17L4A6NCW7 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP17L4A6NCW7 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
USP17L4A6NCW7 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP17L4A6NCW7 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP17L4A6NCW7 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP17L4A6NCW7 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP17L4A6NCW7 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP17L4A6NCW7 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
USP17L4A6NCW7 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP17L4A6NCW7 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP17L4A6NCW7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP17L4A6NCW7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP17L4A6NCW7 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
USP17L4A6NCW7 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP17L4A6NCW7 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP17L4A6NCW7 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP17L4A6NCW7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP17L4A6NCW7 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP17L4A6NCW7 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP17L4A6NCW7 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP17L4A6NCW7 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP17L4A6NCW7 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP17L4A6NCW7 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP17L4A6NCW7 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP17L4A6NCW7 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP17L4A6NCW7 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP17L4A6NCW7 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP17L4A6NCW7 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP17L4A6NCW7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP17L4A6NCW7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP17L4A6NCW7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP17L4A6NCW7 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP17L4A6NCW7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP17L4A6NCW7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP17L4A6NCW7 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP17L4A6NCW7 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP17L4A6NCW7 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP17L4A6NCW7 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
USP17L4A6NCW7 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP17L4A6NCW7 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP17L4A6NCW7 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP17L4A6NCW7 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP17L4A6NCW7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP17L4A6NCW7 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP17L4A6NCW7 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP17L4A6NCW7 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP17L4A6NCW7 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP17L4A6NCW7 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP17L4A6NCW7 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP17L4A6NCW7 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP17L4A6NCW7 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP17L4A6NCW7 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP17L4A6NCW7 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP17L4A6NCW7 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP17L4A6NCW7 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP17L4A6NCW7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP17L4A6NCW7 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
USP17L4A6NCW7 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP17L4A6NCW7 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP17L4A6NCW7 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP17L4A6NCW7 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP17L4A6NCW7 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP17L4A6NCW7 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP17L4A6NCW7 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP17L4A6NCW7 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP17L4A6NCW7 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP17L4A6NCW7 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP17L4A6NCW7 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP17L4A6NCW7 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP17L4A6NCW7 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP17L4A6NCW7 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP17L4A6NCW7 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP17L4A6NCW7 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP17L4A6NCW7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP17L4A6NCW7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
USP17L4A6NCW7 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms