Protein–RNA interactions for Protein: A3KN83

SBNO1, Protein strawberry notch homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO1A3KN83 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SBNO1A3KN83 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SBNO1A3KN83 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SBNO1A3KN83 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SBNO1A3KN83 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SBNO1A3KN83 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SBNO1A3KN83 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SBNO1A3KN83 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SBNO1A3KN83 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SBNO1A3KN83 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SBNO1A3KN83 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SBNO1A3KN83 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SBNO1A3KN83 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SBNO1A3KN83 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SBNO1A3KN83 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SBNO1A3KN83 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SBNO1A3KN83 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SBNO1A3KN83 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SBNO1A3KN83 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SBNO1A3KN83 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SBNO1A3KN83 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SBNO1A3KN83 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SBNO1A3KN83 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SBNO1A3KN83 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SBNO1A3KN83 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SBNO1A3KN83 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SBNO1A3KN83 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SBNO1A3KN83 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SBNO1A3KN83 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SBNO1A3KN83 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SBNO1A3KN83 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SBNO1A3KN83 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SBNO1A3KN83 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SBNO1A3KN83 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SBNO1A3KN83 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SBNO1A3KN83 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SBNO1A3KN83 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SBNO1A3KN83 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SBNO1A3KN83 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SBNO1A3KN83 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SBNO1A3KN83 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SBNO1A3KN83 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SBNO1A3KN83 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SBNO1A3KN83 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SBNO1A3KN83 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SBNO1A3KN83 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SBNO1A3KN83 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SBNO1A3KN83 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SBNO1A3KN83 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SBNO1A3KN83 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SBNO1A3KN83 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
SBNO1A3KN83 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SBNO1A3KN83 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SBNO1A3KN83 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SBNO1A3KN83 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SBNO1A3KN83 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SBNO1A3KN83 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SBNO1A3KN83 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SBNO1A3KN83 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SBNO1A3KN83 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SBNO1A3KN83 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SBNO1A3KN83 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SBNO1A3KN83 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SBNO1A3KN83 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SBNO1A3KN83 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SBNO1A3KN83 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SBNO1A3KN83 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SBNO1A3KN83 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SBNO1A3KN83 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SBNO1A3KN83 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SBNO1A3KN83 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SBNO1A3KN83 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SBNO1A3KN83 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SBNO1A3KN83 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SBNO1A3KN83 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SBNO1A3KN83 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SBNO1A3KN83 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SBNO1A3KN83 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SBNO1A3KN83 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SBNO1A3KN83 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
SBNO1A3KN83 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SBNO1A3KN83 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SBNO1A3KN83 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SBNO1A3KN83 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SBNO1A3KN83 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SBNO1A3KN83 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SBNO1A3KN83 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SBNO1A3KN83 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SBNO1A3KN83 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SBNO1A3KN83 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SBNO1A3KN83 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SBNO1A3KN83 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SBNO1A3KN83 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SBNO1A3KN83 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SBNO1A3KN83 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SBNO1A3KN83 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SBNO1A3KN83 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SBNO1A3KN83 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SBNO1A3KN83 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SBNO1A3KN83 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms